25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1837 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_1837  hypothetical protein  100 
 
 
509 aa  1013    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01940  hypothetical protein  50.78 
 
 
360 aa  293  4e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.705916 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2005  transcriptional regulator, XRE family  47.57 
 
 
388 aa  263  4.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.445906  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2698  hypothetical protein  48.88 
 
 
514 aa  177  5e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.570232 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2840  hypothetical protein  35.34 
 
 
503 aa  177  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43612  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1827  hypothetical protein  44.13 
 
 
484 aa  174  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1829  hypothetical protein  55.62 
 
 
519 aa  169  9e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.790785  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3995  hypothetical protein  62.88 
 
 
535 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2638  hypothetical protein  35.45 
 
 
526 aa  163  6e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316802  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3993  hypothetical protein  59.57 
 
 
346 aa  160  7e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.522345  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2378  hypothetical protein  66.94 
 
 
255 aa  159  9e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2802  hypothetical protein  64.12 
 
 
537 aa  159  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2626  hypothetical protein  54.6 
 
 
519 aa  155  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1817  hypothetical protein  58.33 
 
 
527 aa  150  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0051  hypothetical protein  32.79 
 
 
565 aa  140  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2699  hypothetical protein  55 
 
 
175 aa  140  7e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.979675  normal  0.518352 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0401  hypothetical protein  56.06 
 
 
181 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7229  transcriptional regulator, XRE family  33.98 
 
 
470 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2029  hypothetical protein  66.67 
 
 
148 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.775035  normal  0.520928 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4805  hypothetical protein  28.48 
 
 
478 aa  58.2  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  normal  0.646806 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5975  hypothetical protein  37.96 
 
 
228 aa  57  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.718615  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0163  hypothetical protein  33.05 
 
 
505 aa  54.7  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0309  hypothetical protein  27.86 
 
 
315 aa  54.3  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0564  hypothetical protein  31.79 
 
 
554 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.19709 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1195  putative transcriptional regulator  24.61 
 
 
441 aa  43.1  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>