20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0401 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0401  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  362  1e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2699  hypothetical protein  64.91 
 
 
175 aa  216  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.979675  normal  0.518352 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3995  hypothetical protein  58.27 
 
 
535 aa  156  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1817  hypothetical protein  55.94 
 
 
527 aa  155  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1829  hypothetical protein  58.87 
 
 
519 aa  154  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.790785  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1827  hypothetical protein  52.69 
 
 
484 aa  152  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2698  hypothetical protein  54.25 
 
 
514 aa  152  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.570232 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3993  hypothetical protein  55 
 
 
346 aa  146  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.522345  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2378  hypothetical protein  64.04 
 
 
255 aa  144  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2840  hypothetical protein  51.14 
 
 
503 aa  138  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43612  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2802  hypothetical protein  57.46 
 
 
537 aa  133  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2626  hypothetical protein  51.22 
 
 
519 aa  133  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1837  hypothetical protein  56.06 
 
 
509 aa  129  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2638  hypothetical protein  54.96 
 
 
526 aa  119  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316802  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0051  hypothetical protein  53.37 
 
 
565 aa  102  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2029  hypothetical protein  62.86 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.775035  normal  0.520928 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0163  hypothetical protein  31.4 
 
 
505 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5975  hypothetical protein  34.19 
 
 
228 aa  45.1  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.718615  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0655  hypothetical protein  35.09 
 
 
181 aa  42  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.143096 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0564  hypothetical protein  34.15 
 
 
554 aa  41.6  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.19709 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>