20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2378 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2378  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  513  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2698  hypothetical protein  64.89 
 
 		 514 aa  162  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.570232 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3993  hypothetical protein  63.78 
 
 		 346 aa  151  8e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.522345  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2699  hypothetical protein  54.19 
 
 		 175 aa  151  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.979675  normal  0.518352 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1829  hypothetical protein  54.73 
 
 		 519 aa  150  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.790785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3995  hypothetical protein  48.82 
 
 		 535 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1827  hypothetical protein  62.61 
 
 		 484 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2802  hypothetical protein  66.1 
 
 		 537 aa  145  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0401  hypothetical protein  64.04 
 
 		 181 aa  144  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1837  hypothetical protein  69.23 
 
 		 509 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2626  hypothetical protein  56.49 
 
 		 519 aa  139  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1817  hypothetical protein  58.2 
 
 		 527 aa  137  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2638  hypothetical protein  53.7 
 
 		 526 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2840  hypothetical protein  47.12 
 
 		 503 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0051  hypothetical protein  70.48 
 
 		 565 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5975  hypothetical protein  39.62 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.718615  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2029  hypothetical protein  56.72 
 
 		 148 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.775035  normal  0.520928 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0655  hypothetical protein  34.91 
 
 		 181 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.143096 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0564  hypothetical protein  35.29 
 
 		 554 aa  52.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.19709 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0163  hypothetical protein  32.73 
 
 		 505 aa  48.9  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>