40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1829 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2626  hypothetical protein  82.5 
 
 		 519 aa  806    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1829  hypothetical protein  100 
 
 		 519 aa  1033    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.790785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1827  hypothetical protein  57.17 
 
 		 484 aa  509  1e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2840  hypothetical protein  52.32 
 
 		 503 aa  462  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3995  hypothetical protein  79.45 
 
 		 535 aa  245  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2802  hypothetical protein  37.02 
 
 		 537 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3993  hypothetical protein  76.76 
 
 		 346 aa  231  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.522345  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1817  hypothetical protein  74.66 
 
 		 527 aa  231  3e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2638  hypothetical protein  36.56 
 
 		 526 aa  229  8e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4090  twin-arginine translocation pathway signal  39.9 
 
 		 503 aa  228  3e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0917  hypothetical protein  43.88 
 
 		 342 aa  205  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2698  hypothetical protein  36.9 
 
 		 514 aa  194  4e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.570232 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2699  hypothetical protein  62.6 
 
 		 175 aa  162  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.979675  normal  0.518352 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0401  hypothetical protein  58.87 
 
 		 181 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2378  hypothetical protein  58.46 
 
 		 255 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1837  hypothetical protein  61.83 
 
 		 509 aa  146  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0051  hypothetical protein  66.39 
 
 		 565 aa  127  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2029  hypothetical protein  70.73 
 
 		 148 aa  105  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.775035  normal  0.520928 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2538  putative DNA-binding protein  31.1 
 
 		 434 aa  104  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0510  helix-turn-helix domain-containing protein  29.66 
 
 		 473 aa  83.2  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0895  putative DNA-binding protein  29.29 
 
 		 503 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0013  hypothetical protein  29.69 
 
 		 418 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6151  putative transcriptional regulator  24.68 
 
 		 449 aa  61.6  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764047  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5500  helix-turn-helix domain protein  31.32 
 
 		 400 aa  59.7  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000165306  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0466  tetratricopeptide TPR_2  27.33 
 
 		 449 aa  59.3  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.924549  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1019  hypothetical protein  28.94 
 
 		 288 aa  56.6  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0731  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  26.55 
 
 		 418 aa  52.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00340964  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0163  hypothetical protein  36.21 
 
 		 505 aa  52.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7489  hypothetical protein  23.84 
 
 		 400 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0882714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0564  hypothetical protein  25.51 
 
 		 554 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.19709 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4608  hypothetical protein  25.24 
 
 		 363 aa  50.8  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2729  transcriptional regulator, XRE family  26.73 
 
 		 431 aa  50.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000809201  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1653  XRE family transcriptional regulator  24 
 
 		 397 aa  48.9  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0453749  normal  0.0870716 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5975  hypothetical protein  32.41 
 
 		 228 aa  47.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.718615  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0655  hypothetical protein  32.69 
 
 		 181 aa  47.8  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.143096 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7529  transcriptional regulator, XRE family  26.09 
 
 		 457 aa  47  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1662  hypothetical protein  28.9 
 
 		 403 aa  46.6  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.387756  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0125  XRE family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 412 aa  46.2  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.97143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4805  hypothetical protein  26.55 
 
 		 478 aa  44.3  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  normal  0.646806 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1195  putative transcriptional regulator  26.16 
 
 		 441 aa  43.5  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>