20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0917 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0917  hypothetical protein  100 
 
 		 342 aa  684    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1827  hypothetical protein  51.91 
 
 		 484 aa  242  7e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2840  hypothetical protein  50.76 
 
 		 503 aa  236  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4090  twin-arginine translocation pathway signal  46.95 
 
 		 503 aa  224  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1829  hypothetical protein  43.88 
 
 		 519 aa  205  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.790785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2626  hypothetical protein  43.77 
 
 		 519 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2802  hypothetical protein  34.39 
 
 		 537 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0510  helix-turn-helix domain-containing protein  31.34 
 
 		 473 aa  86.3  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2538  putative DNA-binding protein  30.11 
 
 		 434 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5500  helix-turn-helix domain protein  31.52 
 
 		 400 aa  65.9  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000165306  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2729  transcriptional regulator, XRE family  31.48 
 
 		 431 aa  62.8  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000809201  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0895  putative DNA-binding protein  26.13 
 
 		 503 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0731  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29 
 
 		 418 aa  60.5  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00340964  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0013  hypothetical protein  26.7 
 
 		 418 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7489  hypothetical protein  26.74 
 
 		 400 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0882714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7529  transcriptional regulator, XRE family  29.81 
 
 		 457 aa  54.3  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1962  XRE family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 410 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.622079 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4607  hypothetical protein  28.93 
 
 		 369 aa  51.2  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1019  hypothetical protein  24.54 
 
 		 288 aa  50.8  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1662  hypothetical protein  26.37 
 
 		 403 aa  43.1  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.387756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>