41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0564 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0564  hypothetical protein  100 
 
 
554 aa  1122    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.19709 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2840  hypothetical protein  28.05 
 
 
503 aa  104  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43612  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0655  hypothetical protein  51.92 
 
 
181 aa  99.8  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.143096 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5975  hypothetical protein  46.9 
 
 
228 aa  93.6  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.718615  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2638  hypothetical protein  26.16 
 
 
526 aa  92.8  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316802  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2802  hypothetical protein  26.58 
 
 
537 aa  87.8  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1827  hypothetical protein  26.29 
 
 
484 aa  77  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2698  hypothetical protein  25.85 
 
 
514 aa  70.5  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.570232 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2626  hypothetical protein  26 
 
 
519 aa  67.8  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6151  putative transcriptional regulator  25.97 
 
 
449 aa  65.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764047  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7319  putative DNA-binding protein  25.9 
 
 
432 aa  62  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000491826  decreased coverage  0.00000000376274 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4805  hypothetical protein  27.43 
 
 
478 aa  59.7  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  normal  0.646806 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3995  hypothetical protein  34.04 
 
 
535 aa  59.7  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8777  transcriptional regulator  29.41 
 
 
469 aa  59.3  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.756748 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2889  putative DNA-binding protein  25.2 
 
 
477 aa  57  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0241549  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1829  hypothetical protein  25.89 
 
 
519 aa  56.6  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.790785  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14230  hypothetical protein  25.66 
 
 
433 aa  56.6  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413871  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0466  tetratricopeptide TPR_2  25.5 
 
 
449 aa  55.1  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.924549  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8297  hypothetical protein  25.6 
 
 
452 aa  54.3  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2538  putative DNA-binding protein  26.22 
 
 
434 aa  53.9  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1662  hypothetical protein  25.12 
 
 
403 aa  53.5  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.387756  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6883  putative transcriptional regulator  25 
 
 
429 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0592787  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2378  hypothetical protein  35.29 
 
 
255 aa  52.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3993  hypothetical protein  32.77 
 
 
346 aa  52  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.522345  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1195  putative transcriptional regulator  24.7 
 
 
441 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4608  hypothetical protein  25.24 
 
 
363 aa  49.7  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00560  Helix-turn-helix protein  28.39 
 
 
456 aa  49.7  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.95745 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3448  hypothetical protein  29.88 
 
 
413 aa  48.5  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2327  hypothetical protein  25.27 
 
 
502 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8001  hypothetical protein  27.59 
 
 
487 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1817  hypothetical protein  33.33 
 
 
527 aa  48.1  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1379  XRE family transcriptional regulator  26.69 
 
 
507 aa  47.4  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.464445  normal  0.0167147 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0037  transcriptional regulator, XRE family  33.08 
 
 
460 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1073  hypothetical protein  24.78 
 
 
579 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542041  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2422  hypothetical protein  36.36 
 
 
510 aa  45.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0414042  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4484  hypothetical protein  26.09 
 
 
447 aa  44.7  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0895  putative DNA-binding protein  24.68 
 
 
503 aa  44.3  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1962  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 
410 aa  43.9  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.622079 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6314  helix-turn-helix domain-containing protein  25.41 
 
 
443 aa  43.9  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5136  XRE family transcriptional regulator  32.99 
 
 
488 aa  43.9  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.033803 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0264  hypothetical protein  32.06 
 
 
411 aa  43.5  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>