36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3715 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3715  hypothetical protein  100 
 
 		 460 aa  904    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000995808  normal  0.471663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1998  hypothetical protein  45.43 
 
 		 460 aa  318  2e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101502  normal  0.104668 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2422  hypothetical protein  36.8 
 
 		 510 aa  197  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0414042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8297  hypothetical protein  32.2 
 
 		 452 aa  143  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4484  hypothetical protein  34.85 
 
 		 447 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8777  transcriptional regulator  32.02 
 
 		 469 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.756748 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1107  hypothetical protein  31.01 
 
 		 468 aa  103  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551011  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4805  hypothetical protein  32.73 
 
 		 478 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  normal  0.646806 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1224  regulator  30.98 
 
 		 453 aa  101  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483288  normal  0.967223 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3968  hypothetical protein  30.53 
 
 		 457 aa  94  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0256959  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8001  hypothetical protein  29.18 
 
 		 487 aa  91.3  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3660  putative transcriptional regulator  30.43 
 
 		 463 aa  89.7  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3448  hypothetical protein  31.9 
 
 		 413 aa  87.4  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2899  hypothetical protein  36.75 
 
 		 467 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1073  hypothetical protein  29.25 
 
 		 579 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14230  hypothetical protein  29.35 
 
 		 433 aa  68.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1195  putative transcriptional regulator  25.13 
 
 		 441 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3334  hypothetical protein  28.01 
 
 		 524 aa  58.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.176126  hitchhiker  0.000765121 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6883  putative transcriptional regulator  29.8 
 
 		 429 aa  57  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0592787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6151  putative transcriptional regulator  34.55 
 
 		 449 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764047  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2377  hypothetical protein  28.91 
 
 		 437 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1959  XRE family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 461 aa  50.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0466  tetratricopeptide TPR_2  26.79 
 
 		 449 aa  50.1  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.924549  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2498  XRE family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 474 aa  50.1  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.153795 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0512  transcriptional regulator, XRE family  28.05 
 
 		 401 aa  50.1  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5136  XRE family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 488 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.033803 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5210  transcriptional regulator, XRE family  32.61 
 
 		 530 aa  48.5  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.035838  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9241  hypothetical protein  34.57 
 
 		 428 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0895  putative DNA-binding protein  30.21 
 
 		 503 aa  47.4  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2886  putative regulatory protein  35.67 
 
 		 202 aa  47  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000113276  normal  0.634194 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3947  hypothetical protein  34.86 
 
 		 146 aa  46.2  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1653  XRE family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 397 aa  44.7  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0453749  normal  0.0870716 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2638  hypothetical protein  34.15 
 
 		 526 aa  44.3  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2889  putative DNA-binding protein  26.27 
 
 		 477 aa  43.9  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0241549  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0013  hypothetical protein  26.23 
 
 		 418 aa  43.9  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0125  XRE family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 412 aa  43.1  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.97143 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>