14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9241 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9241  hypothetical protein  100 
 
 		 428 aa  864    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7276  hypothetical protein  27.47 
 
 		 475 aa  90.1  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209812  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0163  hypothetical protein  28.04 
 
 		 505 aa  84  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0051  hypothetical protein  26.49 
 
 		 565 aa  76.6  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3931  hypothetical protein  24.05 
 
 		 445 aa  71.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00536629  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5545  XRE family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 443 aa  70.1  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6314  helix-turn-helix domain-containing protein  29.5 
 
 		 443 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1022  XRE family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 441 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.936661 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4668  hypothetical protein  30.62 
 
 		 425 aa  67.8  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2099  tetratricopeptide TPR_4  30 
 
 		 470 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1397  hypothetical protein  28.15 
 
 		 443 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2311  helix-turn-helix domain-containing protein  27.47 
 
 		 424 aa  49.3  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.4937 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3226  hypothetical protein  26.75 
 
 		 443 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.407522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3715  hypothetical protein  34.57 
 
 		 460 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000995808  normal  0.471663 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>