19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2099 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2099  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 470 aa  940    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0163  hypothetical protein  39.78 
 
 		 505 aa  209  9e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3392  twin-arginine translocation pathway signal  29.54 
 
 		 479 aa  113  7.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7276  hypothetical protein  29.57 
 
 		 475 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209812  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4668  hypothetical protein  33.33 
 
 		 425 aa  86.3  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6244  hypothetical protein  29.74 
 
 		 418 aa  75.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.699378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9241  hypothetical protein  30 
 
 		 428 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3931  hypothetical protein  27.15 
 
 		 445 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00536629  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3737  hypothetical protein  46.07 
 
 		 149 aa  72.4  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.890664 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0087  hypothetical protein  36.94 
 
 		 345 aa  68.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1022  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 441 aa  62  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.936661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6314  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 443 aa  61.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5545  XRE family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 443 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0051  hypothetical protein  30.87 
 
 		 565 aa  58.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0245  hypothetical protein  37.11 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2311  helix-turn-helix domain-containing protein  31.97 
 
 		 424 aa  49.7  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.4937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7352  hypothetical protein  24.63 
 
 		 518 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1397  hypothetical protein  30.99 
 
 		 443 aa  47.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3226  hypothetical protein  31.58 
 
 		 443 aa  45.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.407522 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>