36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7352 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2547  hypothetical protein  67.82 
 
 
545 aa  657    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.441995  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7352  hypothetical protein  100 
 
 
518 aa  1048    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1336  hypothetical protein  55.49 
 
 
556 aa  555  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0410246  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2662  hypothetical protein  30.88 
 
 
482 aa  187  5e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7615  hypothetical protein  32.83 
 
 
477 aa  186  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.706706  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1397  hypothetical protein  33.73 
 
 
443 aa  78.2  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0051  hypothetical protein  26.14 
 
 
565 aa  77.8  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4652  hypothetical protein  28.74 
 
 
339 aa  75.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3226  hypothetical protein  33.73 
 
 
443 aa  70.1  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.407522 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4655  hypothetical protein  26.63 
 
 
455 aa  69.7  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1672  transcriptional regulator, XRE family  23.87 
 
 
442 aa  68.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000955969  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3484  XRE family transcriptional regulator  26.13 
 
 
439 aa  64.3  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1022  XRE family transcriptional regulator  28.98 
 
 
441 aa  63.9  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.936661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6314  helix-turn-helix domain-containing protein  28.57 
 
 
443 aa  63.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5545  XRE family transcriptional regulator  28.37 
 
 
443 aa  62.4  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3968  hypothetical protein  27.65 
 
 
457 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0256959  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4654  helix-turn-helix domain protein  32.17 
 
 
431 aa  58.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0952  hypothetical protein  26.35 
 
 
444 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7276  hypothetical protein  37.93 
 
 
475 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209812  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4245  hypothetical protein  28.67 
 
 
316 aa  55.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0163  hypothetical protein  25.24 
 
 
505 aa  51.6  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2889  putative DNA-binding protein  30.73 
 
 
477 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0241549  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3650  hypothetical protein  24.59 
 
 
461 aa  50.1  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4891  hypothetical protein  24.84 
 
 
444 aa  49.7  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3630  helix-turn-helix domain protein  26.5 
 
 
429 aa  48.9  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.904143  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6151  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 
449 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764047  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1107  hypothetical protein  26.25 
 
 
468 aa  48.5  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551011  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3334  hypothetical protein  23.28 
 
 
524 aa  47.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.176126  hitchhiker  0.000765121 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7229  transcriptional regulator, XRE family  29.49 
 
 
470 aa  47.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8001  hypothetical protein  32.54 
 
 
487 aa  47.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3392  twin-arginine translocation pathway signal  23.21 
 
 
479 aa  46.6  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0087  hypothetical protein  31.82 
 
 
345 aa  46.2  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1942  hypothetical protein  23.26 
 
 
449 aa  45.8  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251834  normal  0.229464 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3948  hypothetical protein  23.39 
 
 
419 aa  45.8  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3628  hypothetical protein  28.11 
 
 
320 aa  45.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2099  tetratricopeptide TPR_4  24.09 
 
 
470 aa  44.7  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>