35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0245 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0245  hypothetical protein  100 
 
 
346 aa  704    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0087  hypothetical protein  62.57 
 
 
345 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0250  hypothetical protein  63.33 
 
 
310 aa  292  7e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2268  shikimate kinase  40.62 
 
 
206 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.597105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2135  hypothetical protein  40.62 
 
 
206 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2079  hypothetical protein  40.62 
 
 
206 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1537  hypothetical protein  39.38 
 
 
205 aa  102  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.516137 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1993  P-loop ATPase protein  40.12 
 
 
205 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1644  hypothetical protein  36.99 
 
 
248 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2309  hypothetical protein  39.38 
 
 
206 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3695  hypothetical protein  42.53 
 
 
186 aa  100  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1722  hypothetical protein  38.12 
 
 
205 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1736  hypothetical protein  38.12 
 
 
205 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.679061 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2267  P-loop ATPase protein  38.12 
 
 
205 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1242  hypothetical protein  36.59 
 
 
222 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1644  hypothetical protein  37.5 
 
 
205 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5015  hypothetical protein  36.31 
 
 
201 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.549407  normal  0.103433 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2638  putative ATP-ase  36.08 
 
 
192 aa  94.4  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0977  hypothetical protein  40.31 
 
 
180 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.518817  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0819  putative ATP-ase  34.81 
 
 
192 aa  88.6  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131239  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6356  hypothetical protein  37.98 
 
 
179 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2639  P-loop ATPase  27.08 
 
 
196 aa  85.9  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.291525 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0720  putative ATP-ase  31.11 
 
 
198 aa  84  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0210  hypothetical protein  32.21 
 
 
197 aa  81.6  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2634  hypothetical protein  31.49 
 
 
190 aa  81.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000975527  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3392  twin-arginine translocation pathway signal  40.91 
 
 
479 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0904  hypothetical protein  35.59 
 
 
223 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2484  hypothetical protein  30.77 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3737  hypothetical protein  43.9 
 
 
149 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.890664 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4819  hypothetical protein  29.41 
 
 
202 aa  67.4  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0586  hypothetical protein  28.57 
 
 
197 aa  64.7  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.883676  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2099  tetratricopeptide TPR_4  37.11 
 
 
470 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0514  hypothetical protein  29.17 
 
 
520 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0345862  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2811  hypothetical protein  33.08 
 
 
533 aa  43.9  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00343166  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_455  hypothetical protein  28.12 
 
 
520 aa  43.5  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000133416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>