35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0720 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0720  putative ATP-ase  100 
 
 
198 aa  413  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2638  putative ATP-ase  50.26 
 
 
192 aa  191  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0819  putative ATP-ase  48.69 
 
 
192 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131239  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2309  hypothetical protein  45.74 
 
 
206 aa  179  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2135  hypothetical protein  45.21 
 
 
206 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2079  hypothetical protein  45.21 
 
 
206 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2268  shikimate kinase  45.21 
 
 
206 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.597105  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1537  hypothetical protein  44.02 
 
 
205 aa  170  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.516137 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1722  hypothetical protein  42.55 
 
 
205 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1736  hypothetical protein  42.02 
 
 
205 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.679061 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1242  hypothetical protein  43.16 
 
 
222 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5015  hypothetical protein  42.62 
 
 
201 aa  166  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.549407  normal  0.103433 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1993  P-loop ATPase protein  48.72 
 
 
205 aa  166  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1644  hypothetical protein  42.93 
 
 
248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1644  hypothetical protein  42.93 
 
 
205 aa  165  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2267  P-loop ATPase protein  42.19 
 
 
205 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0977  hypothetical protein  43.37 
 
 
180 aa  147  7e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.518817  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6356  hypothetical protein  40.61 
 
 
179 aa  140  9e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0250  hypothetical protein  32.48 
 
 
310 aa  85.9  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0245  hypothetical protein  31.11 
 
 
346 aa  84  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2484  hypothetical protein  30 
 
 
212 aa  82.8  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0087  hypothetical protein  32.9 
 
 
345 aa  81.3  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2634  hypothetical protein  30.65 
 
 
190 aa  80.5  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000975527  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2639  P-loop ATPase  30.13 
 
 
196 aa  77.4  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.291525 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0586  hypothetical protein  27.72 
 
 
197 aa  72.8  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.883676  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3695  hypothetical protein  31.45 
 
 
186 aa  70.9  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4819  hypothetical protein  28.41 
 
 
202 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0904  hypothetical protein  27.56 
 
 
223 aa  64.3  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0210  hypothetical protein  28.12 
 
 
197 aa  62.4  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0514  hypothetical protein  28.03 
 
 
520 aa  46.6  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0345862  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_455  hypothetical protein  28.03 
 
 
520 aa  46.2  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000133416  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1249  kinase-like  27.78 
 
 
195 aa  45.4  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0490  hypothetical protein  28.3 
 
 
520 aa  44.7  0.0008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.180685  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_9914  kinase  28.39 
 
 
175 aa  43.9  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.697691  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2613  hypothetical protein  26 
 
 
512 aa  41.6  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.209456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>