41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2484 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2484  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0586  hypothetical protein  75.13 
 
 
197 aa  285  4e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.883676  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2634  hypothetical protein  71.98 
 
 
190 aa  268  5e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000975527  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0904  hypothetical protein  62.43 
 
 
223 aa  236  3e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4819  hypothetical protein  60.24 
 
 
202 aa  204  7e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0720  putative ATP-ase  30 
 
 
198 aa  82.8  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2639  P-loop ATPase  25.88 
 
 
196 aa  82.8  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.291525 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0087  hypothetical protein  30.81 
 
 
345 aa  79  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2309  hypothetical protein  35.48 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2268  shikimate kinase  35.48 
 
 
206 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.597105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2135  hypothetical protein  35.48 
 
 
206 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2079  hypothetical protein  35.48 
 
 
206 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2267  P-loop ATPase protein  31.58 
 
 
205 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1993  P-loop ATPase protein  31.58 
 
 
205 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2638  putative ATP-ase  31.93 
 
 
192 aa  72.8  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0819  putative ATP-ase  33.53 
 
 
192 aa  71.6  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131239  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0245  hypothetical protein  30.77 
 
 
346 aa  70.9  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0977  hypothetical protein  37.9 
 
 
180 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.518817  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1537  hypothetical protein  31.58 
 
 
205 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.516137 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1644  hypothetical protein  33.12 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1736  hypothetical protein  31.58 
 
 
205 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.679061 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1242  hypothetical protein  30.92 
 
 
222 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1722  hypothetical protein  31.58 
 
 
205 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5015  hypothetical protein  30 
 
 
201 aa  67  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.549407  normal  0.103433 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1644  hypothetical protein  32.47 
 
 
248 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6356  hypothetical protein  33.06 
 
 
179 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0250  hypothetical protein  27.84 
 
 
310 aa  58.2  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0210  hypothetical protein  27.37 
 
 
197 aa  57.8  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3695  hypothetical protein  31.9 
 
 
186 aa  55.1  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0912  hypothetical protein  29.32 
 
 
544 aa  47.8  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0811  guanylate kinase  27.56 
 
 
206 aa  46.6  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.990051 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1335  guanylate kinase  29.49 
 
 
206 aa  46.2  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4329  guanylate kinase  29.49 
 
 
206 aa  45.8  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.970942  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3147  guanylate kinase  28.21 
 
 
206 aa  45.8  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0985  guanylate kinase  26.54 
 
 
207 aa  44.7  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00175631  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0651  aminoglycoside phosphotransferase  30.6 
 
 
509 aa  44.3  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1145  guanylate kinase  25.93 
 
 
207 aa  43.9  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49439  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0862  guanylate kinase  31.65 
 
 
206 aa  43.9  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.693982  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0947  guanylate kinase  31.65 
 
 
206 aa  43.9  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000973722  hitchhiker  0.000000351977 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3695  guanylate kinase  29.89 
 
 
225 aa  42.4  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.241605 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2280  guanylate kinase  34.21 
 
 
229 aa  41.6  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>