36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2638 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2638  putative ATP-ase  100 
 
 		 192 aa  396  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0819  putative ATP-ase  83.85 
 
 		 192 aa  343  7e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131239  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2309  hypothetical protein  68.06 
 
 		 206 aa  266  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1537  hypothetical protein  68.45 
 
 		 205 aa  265  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.516137 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2268  shikimate kinase  67.74 
 
 		 206 aa  261  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.597105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2135  hypothetical protein  67.74 
 
 		 206 aa  261  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2079  hypothetical protein  67.74 
 
 		 206 aa  261  4e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1644  hypothetical protein  67.93 
 
 		 248 aa  261  6e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1644  hypothetical protein  66.31 
 
 		 205 aa  260  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1722  hypothetical protein  65.79 
 
 		 205 aa  260  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5015  hypothetical protein  66.84 
 
 		 201 aa  258  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.549407  normal  0.103433 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1736  hypothetical protein  65.26 
 
 		 205 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.679061 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1993  P-loop ATPase protein  65.43 
 
 		 205 aa  253  8e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1242  hypothetical protein  64.71 
 
 		 222 aa  249  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2267  P-loop ATPase protein  63.83 
 
 		 205 aa  245  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0977  hypothetical protein  64.85 
 
 		 180 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.518817  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6356  hypothetical protein  63.41 
 
 		 179 aa  214  9e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0720  putative ATP-ase  50.26 
 
 		 198 aa  191  4e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0245  hypothetical protein  36.08 
 
 		 346 aa  94.4  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0250  hypothetical protein  33.75 
 
 		 310 aa  87.8  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0087  hypothetical protein  33.12 
 
 		 345 aa  79.3  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2634  hypothetical protein  30.69 
 
 		 190 aa  77.8  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000975527  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4819  hypothetical protein  34.59 
 
 		 202 aa  77.8  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2484  hypothetical protein  31.93 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0586  hypothetical protein  31.21 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.883676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0904  hypothetical protein  31.76 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3695  hypothetical protein  33.54 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2639  P-loop ATPase  28.74 
 
 		 196 aa  67.8  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.291525 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0210  hypothetical protein  24.59 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2628  hypothetical protein  25.64 
 
 		 517 aa  44.3  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0612  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  40.91 
 
 		 572 aa  42  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.398101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1575  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  40.91 
 
 		 587 aa  41.2  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1856  sulfate adenylyltransferase  44.74 
 
 		 578 aa  41.2  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0227  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  40.91 
 
 		 568 aa  41.2  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.507724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0255  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  40.91 
 
 		 577 aa  41.2  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.537615 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3340  sulfate adenylyltransferase  38.64 
 
 		 690 aa  41.2  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10273  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>