23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4668 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4668  hypothetical protein  100 
 
 		 425 aa  850    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3931  hypothetical protein  35.59 
 
 		 445 aa  192  8e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00536629  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7276  hypothetical protein  32.27 
 
 		 475 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209812  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6244  hypothetical protein  30.18 
 
 		 418 aa  124  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.699378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0163  hypothetical protein  31.55 
 
 		 505 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2311  helix-turn-helix domain-containing protein  41.84 
 
 		 424 aa  98.6  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.4937 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2099  tetratricopeptide TPR_4  33.33 
 
 		 470 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1022  XRE family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 441 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.936661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6314  helix-turn-helix domain-containing protein  42.59 
 
 		 443 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5545  XRE family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 443 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9241  hypothetical protein  29.52 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1397  hypothetical protein  27.68 
 
 		 443 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0051  hypothetical protein  33.1 
 
 		 565 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4409  hypothetical protein  33.05 
 
 		 473 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3226  hypothetical protein  39.53 
 
 		 443 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.407522 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1954  hypothetical protein  38.46 
 
 		 470 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.0082937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6759  putative HTH-type transcriptional regulator  27.07 
 
 		 427 aa  50.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1336  hypothetical protein  24.83 
 
 		 556 aa  49.7  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0410246  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4891  hypothetical protein  29.23 
 
 		 444 aa  48.9  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0952  hypothetical protein  29.29 
 
 		 444 aa  47.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0523  XRE family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6107  XRE family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 389 aa  44.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0526222 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3392  twin-arginine translocation pathway signal  29.57 
 
 		 479 aa  43.5  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>