52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1397 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1397  hypothetical protein  100 
 
 		 443 aa  890    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3226  hypothetical protein  94.58 
 
 		 443 aa  797    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.407522 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1022  XRE family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 441 aa  264  3e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.936661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6314  helix-turn-helix domain-containing protein  38.13 
 
 		 443 aa  262  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5545  XRE family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 443 aa  261  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0051  hypothetical protein  32.06 
 
 		 565 aa  130  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5282  hypothetical protein  48.94 
 
 		 470 aa  102  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2079  hypothetical protein  51.11 
 
 		 161 aa  95.5  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0491227  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1662  hypothetical protein  37.41 
 
 		 403 aa  92.4  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.387756  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0340  tetratricopeptide domain-containing protein  29.66 
 
 		 418 aa  89.4  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.469664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0702  hypothetical protein  32.02 
 
 		 405 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.554394 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4409  hypothetical protein  29.56 
 
 		 473 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2821  helix-turn-helix domain protein  41.94 
 
 		 290 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803112  hitchhiker  0.00185272 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4805  hypothetical protein  44.44 
 
 		 478 aa  84.3  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  normal  0.646806 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0334  hypothetical protein  47.06 
 
 		 475 aa  80.9  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.663709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0166  hypothetical protein  30 
 
 		 450 aa  80.5  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00671267  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5332  XRE family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 392 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1336  hypothetical protein  28.48 
 
 		 556 aa  78.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0410246  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7352  hypothetical protein  33.73 
 
 		 518 aa  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1136  XRE family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6759  putative HTH-type transcriptional regulator  28.85 
 
 		 427 aa  77  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1270  hypothetical protein  44.05 
 
 		 497 aa  73.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404033  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2547  hypothetical protein  30.46 
 
 		 545 aa  71.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.441995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4668  hypothetical protein  28.04 
 
 		 425 aa  67.8  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3392  twin-arginine translocation pathway signal  30.41 
 
 		 479 aa  67  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0275  hypothetical protein  28.83 
 
 		 348 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.484738  normal  0.794868 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0523  XRE family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4418  tetratricopeptide TPR_4  27.95 
 
 		 439 aa  63.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0163  hypothetical protein  29.65 
 
 		 505 aa  62  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3050  hypothetical protein  26.67 
 
 		 437 aa  62  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6107  XRE family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 389 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0526222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9241  hypothetical protein  28.15 
 
 		 428 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1224  regulator  28.4 
 
 		 453 aa  52.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483288  normal  0.967223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6286  putative HTH-type transcriptional regulator  28.26 
 
 		 472 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0037  transcriptional regulator, XRE family  31.76 
 
 		 460 aa  52.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1195  putative transcriptional regulator  24.91 
 
 		 441 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3931  hypothetical protein  26.73 
 
 		 445 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00536629  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6356  transcriptional regulator, XRE family  24.01 
 
 		 406 aa  51.6  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5529  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 327 aa  50.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4484  hypothetical protein  27.49 
 
 		 447 aa  49.3  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3948  hypothetical protein  24.89 
 
 		 419 aa  49.3  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5071  hypothetical protein  28.57 
 
 		 403 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.105918  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14230  hypothetical protein  22.17 
 
 		 433 aa  48.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8777  transcriptional regulator  30.59 
 
 		 469 aa  47.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.756748 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4244  formylmethionine deformylase  40.68 
 
 		 549 aa  46.6  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.928565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1741  hypothetical protein  50 
 
 		 152 aa  46.6  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331104  normal  0.0742911 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1749  hypothetical protein  27.66 
 
 		 107 aa  46.2  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.558396  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1813  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  34.21 
 
 		 444 aa  45.8  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0510  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 		 473 aa  44.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8001  hypothetical protein  31.65 
 
 		 487 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9064  hypothetical protein  58.82 
 
 		 431 aa  44.3  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2662  hypothetical protein  26.4 
 
 		 482 aa  43.1  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>