16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6286 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6286  putative HTH-type transcriptional regulator  100 
 
 		 472 aa  950    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3050  hypothetical protein  44.39 
 
 		 437 aa  288  2e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4418  tetratricopeptide TPR_4  42.18 
 
 		 439 aa  267  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6759  putative HTH-type transcriptional regulator  33.72 
 
 		 427 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1130  hypothetical protein  35.65 
 
 		 443 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.823409  normal  0.981294 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1954  hypothetical protein  34.67 
 
 		 470 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.0082937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1899  hypothetical protein  34.56 
 
 		 346 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.310153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3308  XRE family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 500 aa  107  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.032044  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1015  putative DNA-binding protein  32.95 
 
 		 351 aa  103  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4164  hypothetical protein  43.2 
 
 		 319 aa  92.8  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00796352  normal  0.264326 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2286  hypothetical protein  33.1 
 
 		 316 aa  89  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00221273  hitchhiker  0.000615766 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1397  hypothetical protein  29.38 
 
 		 443 aa  66.6  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0272  hypothetical protein  33.53 
 
 		 218 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.210928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0051  hypothetical protein  25.07 
 
 		 565 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3226  hypothetical protein  29.77 
 
 		 443 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.407522 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6107  XRE family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 389 aa  45.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0526222 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>