25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6759 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6759  putative HTH-type transcriptional regulator  100 
 
 		 427 aa  853    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3050  hypothetical protein  42.86 
 
 		 437 aa  288  2e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1130  hypothetical protein  43.81 
 
 		 443 aa  266  4e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.823409  normal  0.981294 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4418  tetratricopeptide TPR_4  32.09 
 
 		 439 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6286  putative HTH-type transcriptional regulator  33.03 
 
 		 472 aa  163  7e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1899  hypothetical protein  36.33 
 
 		 346 aa  151  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.310153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1954  hypothetical protein  36.33 
 
 		 470 aa  150  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.0082937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3308  XRE family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 500 aa  144  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.032044  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2286  hypothetical protein  37.02 
 
 		 316 aa  107  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00221273  hitchhiker  0.000615766 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4164  hypothetical protein  35.53 
 
 		 319 aa  106  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00796352  normal  0.264326 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1015  putative DNA-binding protein  34.66 
 
 		 351 aa  100  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1397  hypothetical protein  28.85 
 
 		 443 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3226  hypothetical protein  28.14 
 
 		 443 aa  67.8  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.407522 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0272  hypothetical protein  33.17 
 
 		 218 aa  62  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.210928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0051  hypothetical protein  30.19 
 
 		 565 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1022  XRE family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 441 aa  49.7  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.936661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5545  XRE family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 443 aa  47  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1073  hypothetical protein  24.37 
 
 		 579 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6314  helix-turn-helix domain-containing protein  28.16 
 
 		 443 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4668  hypothetical protein  27.07 
 
 		 425 aa  44.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1195  putative transcriptional regulator  24.7 
 
 		 441 aa  44.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3520  hypothetical protein  25.1 
 
 		 446 aa  43.9  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.80961 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0166  hypothetical protein  29.34 
 
 		 450 aa  43.5  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00671267  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8777  transcriptional regulator  27.57 
 
 		 469 aa  43.5  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.756748 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1336  hypothetical protein  25.56 
 
 		 556 aa  43.5  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0410246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>