21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4418 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4418  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 439 aa  872    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3050  hypothetical protein  48.13 
 
 		 437 aa  315  8e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6286  putative HTH-type transcriptional regulator  41.46 
 
 		 472 aa  246  4.9999999999999997e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6759  putative HTH-type transcriptional regulator  32.09 
 
 		 427 aa  169  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3308  XRE family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 500 aa  150  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.032044  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1954  hypothetical protein  31.94 
 
 		 470 aa  137  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.0082937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1899  hypothetical protein  32.7 
 
 		 346 aa  132  9e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.310153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1130  hypothetical protein  30.88 
 
 		 443 aa  108  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.823409  normal  0.981294 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2286  hypothetical protein  35.09 
 
 		 316 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00221273  hitchhiker  0.000615766 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1015  putative DNA-binding protein  34.51 
 
 		 351 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4164  hypothetical protein  34.43 
 
 		 319 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00796352  normal  0.264326 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1397  hypothetical protein  27.95 
 
 		 443 aa  59.7  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3226  hypothetical protein  28.65 
 
 		 443 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.407522 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3520  hypothetical protein  27.25 
 
 		 446 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.80961 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5545  XRE family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 443 aa  47.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1022  XRE family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 441 aa  47.4  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.936661 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0272  hypothetical protein  34.41 
 
 		 218 aa  47  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.210928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0051  hypothetical protein  27.39 
 
 		 565 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6314  helix-turn-helix domain-containing protein  27.48 
 
 		 443 aa  43.9  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7319  putative DNA-binding protein  30.33 
 
 		 432 aa  44.3  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000491826  decreased coverage  0.00000000376274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6883  putative transcriptional regulator  26.24 
 
 		 429 aa  43.5  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0592787  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>