15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0166 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0166  hypothetical protein  100 
 
 		 450 aa  877    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00671267  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4409  hypothetical protein  66.67 
 
 		 473 aa  528  1e-148  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0051  hypothetical protein  31.67 
 
 		 565 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1397  hypothetical protein  27.87 
 
 		 443 aa  73.2  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0275  hypothetical protein  29.72 
 
 		 348 aa  71.6  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.484738  normal  0.794868 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3226  hypothetical protein  29.58 
 
 		 443 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.407522 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5071  hypothetical protein  31.56 
 
 		 403 aa  67.4  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.105918  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1130  hypothetical protein  26.87 
 
 		 443 aa  63.5  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.823409  normal  0.981294 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1022  XRE family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 441 aa  59.7  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.936661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6314  helix-turn-helix domain-containing protein  25.79 
 
 		 443 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5545  XRE family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 443 aa  57  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3392  twin-arginine translocation pathway signal  28.69 
 
 		 479 aa  55.1  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7319  putative DNA-binding protein  27.19 
 
 		 432 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000491826  decreased coverage  0.00000000376274 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4668  hypothetical protein  29.76 
 
 		 425 aa  49.7  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6759  putative HTH-type transcriptional regulator  29.34 
 
 		 427 aa  43.5  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>