19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1749 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1749  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  220  4.9999999999999996e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.558396  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5529  XRE family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 327 aa  68.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4244  formylmethionine deformylase  35.19 
 
 		 549 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.928565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5332  XRE family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 392 aa  63.5  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1136  XRE family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1662  hypothetical protein  35.16 
 
 		 403 aa  58.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.387756  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1022  XRE family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 441 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.936661 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2079  hypothetical protein  34.02 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0491227  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0334  hypothetical protein  35.53 
 
 		 475 aa  55.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.663709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5545  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 443 aa  52.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6314  helix-turn-helix domain-containing protein  34.44 
 
 		 443 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0340  tetratricopeptide domain-containing protein  32.26 
 
 		 418 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.469664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4805  hypothetical protein  38.04 
 
 		 478 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  normal  0.646806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2821  helix-turn-helix domain protein  32.58 
 
 		 290 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803112  hitchhiker  0.00185272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1397  hypothetical protein  27.66 
 
 		 443 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3226  hypothetical protein  26.6 
 
 		 443 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.407522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0702  hypothetical protein  31.46 
 
 		 405 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.554394 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1813  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  31.18 
 
 		 444 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0037  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 460 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>