59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3334 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3334  hypothetical protein  100 
 
 		 524 aa  1065    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.176126  hitchhiker  0.000765121 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5210  transcriptional regulator, XRE family  36.86 
 
 		 530 aa  278  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.035838  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3992  putative regulatory protein  56.14 
 
 		 249 aa  242  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8001  hypothetical protein  37.73 
 
 		 487 aa  226  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1270  hypothetical protein  34.08 
 
 		 497 aa  212  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1244  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  38.32 
 
 		 515 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3968  hypothetical protein  36.42 
 
 		 457 aa  187  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0256959  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2889  putative DNA-binding protein  30.64 
 
 		 477 aa  172  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0241549  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3993  hypothetical protein  57.78 
 
 		 346 aa  152  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.522345  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4805  hypothetical protein  29.82 
 
 		 478 aa  146  7.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  normal  0.646806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7319  putative DNA-binding protein  29.35 
 
 		 432 aa  143  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000491826  decreased coverage  0.00000000376274 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2377  hypothetical protein  35.43 
 
 		 437 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0037  transcriptional regulator, XRE family  27.23 
 
 		 460 aa  139  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14230  hypothetical protein  29.36 
 
 		 433 aa  137  6.0000000000000005e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00560  Helix-turn-helix protein  25.21 
 
 		 456 aa  134  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.95745 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1107  hypothetical protein  34.2 
 
 		 468 aa  126  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551011  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4090  twin-arginine translocation pathway signal  30.19 
 
 		 503 aa  126  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0895  putative DNA-binding protein  28.9 
 
 		 503 aa  125  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2498  XRE family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 474 aa  124  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.153795 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4484  hypothetical protein  31.74 
 
 		 447 aa  117  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1195  putative transcriptional regulator  27.17 
 
 		 441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2899  hypothetical protein  33.64 
 
 		 467 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8297  hypothetical protein  32.82 
 
 		 452 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0466  tetratricopeptide TPR_2  30.65 
 
 		 449 aa  108  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.924549  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3448  hypothetical protein  33.07 
 
 		 413 aa  109  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1073  hypothetical protein  31.44 
 
 		 579 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6151  putative transcriptional regulator  32.78 
 
 		 449 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764047  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1224  regulator  33.46 
 
 		 453 aa  104  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483288  normal  0.967223 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8777  transcriptional regulator  29.22 
 
 		 469 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.756748 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3080  hypothetical protein  27.68 
 
 		 398 aa  99  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2887  hypothetical protein  44.92 
 
 		 249 aa  93.2  9e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00393929  normal  0.424597 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2422  hypothetical protein  30.38 
 
 		 510 aa  91.7  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0414042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3660  putative transcriptional regulator  28.2 
 
 		 463 aa  90.5  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1959  XRE family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 461 aa  80.5  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2638  hypothetical protein  27.27 
 
 		 526 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1653  XRE family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 397 aa  75.9  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0453749  normal  0.0870716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6883  putative transcriptional regulator  30.12 
 
 		 429 aa  74.3  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0592787  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0125  XRE family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.97143 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07960  Helix-turn-helix protein  24.66 
 
 		 444 aa  63.5  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1710  transcriptional regulator, XRE family  26.62 
 
 		 420 aa  63.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.371639  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6440  hypothetical protein  30.48 
 
 		 311 aa  62.4  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2541  hypothetical protein  47.76 
 
 		 94 aa  60.8  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1998  hypothetical protein  29.12 
 
 		 460 aa  58.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101502  normal  0.104668 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2538  putative DNA-binding protein  25.45 
 
 		 434 aa  57  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1379  XRE family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 507 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.464445  normal  0.0167147 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0597  hypothetical protein  25.47 
 
 		 475 aa  55.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.720535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3715  hypothetical protein  27.21 
 
 		 460 aa  55.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000995808  normal  0.471663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2327  hypothetical protein  31.84 
 
 		 502 aa  54.7  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6314  helix-turn-helix domain-containing protein  24.06 
 
 		 443 aa  53.9  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1022  XRE family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 441 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.936661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5136  XRE family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 488 aa  50.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.033803 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0334  hypothetical protein  25.9 
 
 		 475 aa  48.9  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.663709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7352  hypothetical protein  23.28 
 
 		 518 aa  47.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9064  hypothetical protein  24.6 
 
 		 431 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2886  putative regulatory protein  32.67 
 
 		 202 aa  45.8  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000113276  normal  0.634194 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0751  helix-turn-helix domain protein  27.04 
 
 		 414 aa  44.3  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1942  hypothetical protein  23.83 
 
 		 449 aa  44.3  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251834  normal  0.229464 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2718  hypothetical protein  28.3 
 
 		 452 aa  43.5  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.94605  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2547  hypothetical protein  23.9 
 
 		 545 aa  43.5  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.441995  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>