25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0597 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0597  hypothetical protein  100 
 
 		 475 aa  961    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.720535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6421  hypothetical protein  57.5 
 
 		 127 aa  127  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.119215  normal  0.324857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5136  XRE family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 488 aa  96.3  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.033803 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2377  hypothetical protein  31.25 
 
 		 437 aa  86.7  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1379  XRE family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 507 aa  84.3  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.464445  normal  0.0167147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7319  putative DNA-binding protein  34.65 
 
 		 432 aa  78.2  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000491826  decreased coverage  0.00000000376274 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1131  hypothetical protein  45.16 
 
 		 491 aa  68.2  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2889  putative DNA-binding protein  29.91 
 
 		 477 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0241549  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3334  hypothetical protein  25.47 
 
 		 524 aa  61.6  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.176126  hitchhiker  0.000765121 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1942  hypothetical protein  25.32 
 
 		 449 aa  60.8  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251834  normal  0.229464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2327  hypothetical protein  27.42 
 
 		 502 aa  58.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2718  hypothetical protein  26.96 
 
 		 452 aa  57.8  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.94605  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0334  hypothetical protein  25.89 
 
 		 475 aa  57.8  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.663709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4805  hypothetical protein  26.44 
 
 		 478 aa  56.2  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  normal  0.646806 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1195  putative transcriptional regulator  25.56 
 
 		 441 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9064  hypothetical protein  25.96 
 
 		 431 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1073  hypothetical protein  26.46 
 
 		 579 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7352  hypothetical protein  26.64 
 
 		 518 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8001  hypothetical protein  28.77 
 
 		 487 aa  47.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1107  hypothetical protein  27.12 
 
 		 468 aa  45.8  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551011  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0731  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.73 
 
 		 418 aa  45.8  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00340964  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0512  transcriptional regulator, XRE family  28.52 
 
 		 401 aa  45.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0125  XRE family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 412 aa  44.7  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.97143 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3968  hypothetical protein  28.57 
 
 		 457 aa  44.3  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0256959  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2638  hypothetical protein  27.12 
 
 		 526 aa  43.9  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316802  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>