39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3080 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3080  hypothetical protein  100 
 
 
398 aa  799    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0037  transcriptional regulator, XRE family  28.46 
 
 
460 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3992  putative regulatory protein  33.5 
 
 
249 aa  103  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3334  hypothetical protein  27.68 
 
 
524 aa  99  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.176126  hitchhiker  0.000765121 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5210  transcriptional regulator, XRE family  29.07 
 
 
530 aa  94.7  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.035838  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1244  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.57 
 
 
515 aa  93.6  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4805  hypothetical protein  28.22 
 
 
478 aa  93.6  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  normal  0.646806 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1107  hypothetical protein  31.67 
 
 
468 aa  93.2  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551011  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2377  hypothetical protein  31 
 
 
437 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00560  Helix-turn-helix protein  26.17 
 
 
456 aa  87.8  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.95745 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14230  hypothetical protein  31.1 
 
 
433 aa  86.7  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413871  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2638  hypothetical protein  29.64 
 
 
526 aa  86.7  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316802  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1270  hypothetical protein  28.02 
 
 
497 aa  85.9  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404033  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8001  hypothetical protein  29.77 
 
 
487 aa  84.7  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1224  regulator  28.34 
 
 
453 aa  84  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483288  normal  0.967223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8297  hypothetical protein  29.25 
 
 
452 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2899  hypothetical protein  30.12 
 
 
467 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285709  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1653  XRE family transcriptional regulator  31.8 
 
 
397 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0453749  normal  0.0870716 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3968  hypothetical protein  28.81 
 
 
457 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0256959  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3448  hypothetical protein  27.62 
 
 
413 aa  75.5  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1073  hypothetical protein  27.59 
 
 
579 aa  73.2  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542041  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0512  transcriptional regulator, XRE family  30.89 
 
 
401 aa  72.8  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4484  hypothetical protein  29.34 
 
 
447 aa  69.7  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1195  putative transcriptional regulator  25.68 
 
 
441 aa  69.7  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7319  putative DNA-binding protein  27.16 
 
 
432 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000491826  decreased coverage  0.00000000376274 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3660  putative transcriptional regulator  29.46 
 
 
463 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1959  XRE family transcriptional regulator  27.86 
 
 
461 aa  67  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8777  transcriptional regulator  28.7 
 
 
469 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.756748 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0466  tetratricopeptide TPR_2  28.09 
 
 
449 aa  63.9  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.924549  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2889  putative DNA-binding protein  25.59 
 
 
477 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0241549  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6440  hypothetical protein  30.54 
 
 
311 aa  58.9  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0125  XRE family transcriptional regulator  28.27 
 
 
412 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.97143 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6883  putative transcriptional regulator  31.78 
 
 
429 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0592787  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1710  transcriptional regulator, XRE family  27.85 
 
 
420 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.371639  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6151  putative transcriptional regulator  27 
 
 
449 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764047  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2498  XRE family transcriptional regulator  31.07 
 
 
474 aa  50.8  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.153795 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2422  hypothetical protein  33.72 
 
 
510 aa  47  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0414042  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5136  XRE family transcriptional regulator  35.97 
 
 
488 aa  46.6  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.033803 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2327  hypothetical protein  22.46 
 
 
502 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>