28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2718 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2718  hypothetical protein  100 
 
 		 452 aa  895    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.94605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4489  hypothetical protein  49.55 
 
 		 440 aa  372  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.718463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3650  hypothetical protein  45.54 
 
 		 461 aa  325  1e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2327  hypothetical protein  31.42 
 
 		 502 aa  198  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1942  hypothetical protein  33.11 
 
 		 449 aa  169  9e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251834  normal  0.229464 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0309  hypothetical protein  39.33 
 
 		 315 aa  160  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5136  XRE family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 488 aa  116  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.033803 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1379  XRE family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 507 aa  109  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.464445  normal  0.0167147 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2377  hypothetical protein  27.09 
 
 		 437 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8001  hypothetical protein  27.78 
 
 		 487 aa  67.8  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7319  putative DNA-binding protein  29.13 
 
 		 432 aa  63.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000491826  decreased coverage  0.00000000376274 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0334  hypothetical protein  28.31 
 
 		 475 aa  55.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.663709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2889  putative DNA-binding protein  26.42 
 
 		 477 aa  55.1  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0241549  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4805  hypothetical protein  27.89 
 
 		 478 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  normal  0.646806 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4484  hypothetical protein  26.39 
 
 		 447 aa  51.2  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1073  hypothetical protein  27.32 
 
 		 579 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1813  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29 
 
 		 444 aa  49.7  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9064  hypothetical protein  26.98 
 
 		 431 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1195  putative transcriptional regulator  27.75 
 
 		 441 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6151  putative transcriptional regulator  26.63 
 
 		 449 aa  47.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764047  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00560  Helix-turn-helix protein  25.71 
 
 		 456 aa  47  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.95745 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0466  tetratricopeptide TPR_2  26.63 
 
 		 449 aa  46.6  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.924549  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3334  hypothetical protein  26.94 
 
 		 524 aa  46.2  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.176126  hitchhiker  0.000765121 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1481  transcriptional regulator, XRE family  29.01 
 
 		 427 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  normal  0.39369 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0597  hypothetical protein  26.96 
 
 		 475 aa  44.7  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.720535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3968  hypothetical protein  27.13 
 
 		 457 aa  44.3  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0256959  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8297  hypothetical protein  29.45 
 
 		 452 aa  43.9  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1107  hypothetical protein  28.57 
 
 		 468 aa  43.5  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>