20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0309 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0309  hypothetical protein  100 
 
 
315 aa  627  1e-178  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2327  hypothetical protein  40.54 
 
 
502 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2718  hypothetical protein  40 
 
 
452 aa  151  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.94605  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1942  hypothetical protein  35.42 
 
 
449 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251834  normal  0.229464 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4489  hypothetical protein  34.6 
 
 
440 aa  134  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.718463  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3650  hypothetical protein  36.59 
 
 
461 aa  132  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5136  XRE family transcriptional regulator  32.21 
 
 
488 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.033803 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1379  XRE family transcriptional regulator  30.57 
 
 
507 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.464445  normal  0.0167147 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1195  putative transcriptional regulator  27.89 
 
 
441 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0334  hypothetical protein  28.77 
 
 
475 aa  55.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.663709  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1837  hypothetical protein  30.94 
 
 
509 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0125  XRE family transcriptional regulator  26.58 
 
 
412 aa  53.5  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.97143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9064  hypothetical protein  27.82 
 
 
431 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8297  hypothetical protein  30 
 
 
452 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6151  putative transcriptional regulator  29.15 
 
 
449 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764047  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7319  putative DNA-binding protein  27.15 
 
 
432 aa  49.7  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000491826  decreased coverage  0.00000000376274 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1959  XRE family transcriptional regulator  26.94 
 
 
461 aa  49.3  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14230  hypothetical protein  26.64 
 
 
433 aa  46.2  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413871  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0466  tetratricopeptide TPR_2  26.91 
 
 
449 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.924549  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1653  XRE family transcriptional regulator  26.34 
 
 
397 aa  43.1  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0453749  normal  0.0870716 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>