21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3650 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3650  hypothetical protein  100 
 
 
461 aa  911    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2718  hypothetical protein  45.54 
 
 
452 aa  325  7e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.94605  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4489  hypothetical protein  39.82 
 
 
440 aa  273  5.000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.718463  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2327  hypothetical protein  33.84 
 
 
502 aa  196  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0309  hypothetical protein  37.63 
 
 
315 aa  139  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1942  hypothetical protein  32.73 
 
 
449 aa  139  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251834  normal  0.229464 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5136  XRE family transcriptional regulator  26.38 
 
 
488 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.033803 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1379  XRE family transcriptional regulator  27.14 
 
 
507 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.464445  normal  0.0167147 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1336  hypothetical protein  26.79 
 
 
556 aa  60.5  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0410246  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1813  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.57 
 
 
444 aa  60.1  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0334  hypothetical protein  26.22 
 
 
475 aa  56.6  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.663709  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8001  hypothetical protein  25.31 
 
 
487 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9064  hypothetical protein  28.62 
 
 
431 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2547  hypothetical protein  25.42 
 
 
545 aa  52.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.441995  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4805  hypothetical protein  25.93 
 
 
478 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  normal  0.646806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7352  hypothetical protein  24.59 
 
 
518 aa  50.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2889  putative DNA-binding protein  29.1 
 
 
477 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0241549  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4484  hypothetical protein  25.11 
 
 
447 aa  47.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0264  hypothetical protein  36.23 
 
 
411 aa  45.8  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3992  putative regulatory protein  27.4 
 
 
249 aa  43.5  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1481  transcriptional regulator, XRE family  27.92 
 
 
427 aa  43.9  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  normal  0.39369 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>