30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0807 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0807  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 169 aa  329  1e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1722  helix-turn-helix domain-containing protein  36.71 
 
 		 204 aa  93.6  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1101  helix-turn-helix domain-containing protein  36.71 
 
 		 316 aa  91.7  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2531  hypothetical protein  48.53 
 
 		 110 aa  52  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  44.64 
 
 		 169 aa  49.7  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2651  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 112 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5447  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 103 aa  46.6  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1459  helix-turn-helix domain protein  43.28 
 
 		 182 aa  45.1  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1763  hypothetical protein  40 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592194 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0575  hypothetical protein  38.24 
 
 		 188 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.712175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3519  XRE family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 71 aa  43.9  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4462  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7007  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 110 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0777  XRE family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000109093  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4079  XRE family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0410  putative transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 189 aa  42.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15000  predicted transcriptional regulator  38.67 
 
 		 184 aa  42.4  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.904149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 198 aa  42.7  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1879  transcriptional regulator, XRE family  44.68 
 
 		 182 aa  42  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0378  helix-turn-helix domain-containing protein  39.19 
 
 		 297 aa  42  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.519248  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 115 aa  41.6  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3256  helix-turn-helix domain-containing protein  43.4 
 
 		 136 aa  41.6  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2572  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 76 aa  41.2  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 		 118 aa  41.2  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0378  helix-turn-helix domain-containing protein  31.58 
 
 		 93 aa  41.2  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0365  helix-turn-helix domain-containing protein  31.58 
 
 		 93 aa  41.2  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2208  XRE family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 73 aa  41.2  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0421873 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1409  transcriptional regulator, XRE family  46.43 
 
 		 75 aa  40.8  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.503834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2822  transcriptional regulator, XRE family  44.64 
 
 		 73 aa  40.8  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00025519  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>