31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0589 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0589  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 239 aa  484  1e-136  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0689  XRE family transcriptional regulator  81.28 
 
 		 237 aa  400  1e-111  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1662  XRE family transcriptional regulator  79.24 
 
 		 242 aa  398  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.126051  hitchhiker  0.00273483 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1981  helix-turn-helix domain-containing protein  77.45 
 
 		 237 aa  393  1e-108  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1149  helix-turn-helix domain-containing protein  52.61 
 
 		 243 aa  256  2e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.475219 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  57.14 
 
 		 248 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0552  XRE family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 246 aa  195  6e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1931  XRE family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 246 aa  189  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.380591  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0380  helix-turn-helix domain-containing protein  40.77 
 
 		 229 aa  184  8e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1462  XRE family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 229 aa  184  9e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0457  helix-turn-helix domain-containing protein  40.77 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.335495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0525  helix-turn-helix domain-containing protein  40.34 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0019  helix-turn-helix domain-containing protein  40.77 
 
 		 275 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2360  helix-turn-helix domain-containing protein  41.35 
 
 		 236 aa  180  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0152  XRE family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1389  XRE family transcriptional regulator  43.19 
 
 		 239 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2767  transcriptional regulator, XRE family  39.91 
 
 		 236 aa  170  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0718  transcriptional regulator, XRE family  43.11 
 
 		 224 aa  169  5e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2511  transcriptional regulator, XRE family  40.17 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122746  normal  0.67505 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2056  transcriptional regulator, XRE family  39.83 
 
 		 236 aa  165  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1628  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 236 aa  163  3e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0158  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 236 aa  162  5.0000000000000005e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1744  transcriptional regulator, XRE family  36.05 
 
 		 235 aa  156  3e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.571892  normal  0.738269 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1971  transcriptional regulator, XRE family  35.44 
 
 		 233 aa  155  4e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0813704 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0721  transcriptional regulator, XRE family  37.39 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1598  helix-turn-helix domain-containing protein  36.52 
 
 		 241 aa  148  9e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.141613 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1363  transcriptional regulator, XRE family  33.19 
 
 		 241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0013  XRE family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 135 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0557  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 89 aa  43.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3349  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 115 aa  42.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.185008 
 
 
-
 
NC_002978  WD0626  transcriptional regulator, putative  47.5 
 
 		 303 aa  42  0.008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0882771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>