28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0013 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0013  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 135 aa  270  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 76 aa  51.2  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3148  XRE family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5052  XRE family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.514325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1436  transcriptional regulator, XRE family  45.1 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.118358  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0689  XRE family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 237 aa  44.3  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0858  XRE family transcriptional regulator  51.28 
 
 		 497 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.359757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0941  transcriptional regulator, XRE family  35.23 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.551097  normal  0.0671843 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  37.25 
 
 		 233 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  37.25 
 
 		 233 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0707  XRE family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3219  XRE family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5678  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 90 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.669501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3371  helix-turn-helix domain-containing protein  37.33 
 
 		 88 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2889  DNA-binding protein  27.87 
 
 		 223 aa  42  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0589  helix-turn-helix domain-containing protein  38.46 
 
 		 239 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0828  XRE family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 282 aa  41.2  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  42.59 
 
 		 229 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  42.59 
 
 		 229 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  35.29 
 
 		 233 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5660  XRE family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 490 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176576  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1981  helix-turn-helix domain-containing protein  38.46 
 
 		 237 aa  40.8  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1887  XRE family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0783  XRE family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 394 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.500633  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2568  LacI family transcription regulator  27.05 
 
 		 223 aa  40.4  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0460  XRE family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 325 aa  40.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0685  Cro/CI family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 179 aa  40  0.01  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>