31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3148 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_3148  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 135 aa  276  8e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5052  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 135 aa  276  8e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.514325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3219  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0012  transcriptional regulator  34.33 
 
 		 131 aa  47.4  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388282  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1979  transcriptional regulator, XRE family  37.33 
 
 		 277 aa  47  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4271  transcriptional regulator, XRE family  22.95 
 
 		 125 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.313399 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3945  transcriptional regulator, XRE family  22.95 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  44.07 
 
 		 282 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2759  transcriptional regulator, XRE family  32.84 
 
 		 278 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468237  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0013  XRE family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4130  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 292 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2377  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 283 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000201287  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 299 aa  44.3  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2478  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.85 
 
 		 396 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000277513  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2180  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165219  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4255  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 333 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000524025 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4216  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 333 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4244  helix-turn-helix domain protein  40.68 
 
 		 287 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0524  hypothetical protein  37.1 
 
 		 276 aa  43.5  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3488  XRE family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1527  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1361  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 282 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108942  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3153  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 290 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2077  hypothetical protein  31.34 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5465  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 285 aa  41.2  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0902  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 284 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.477042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1949  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 307 aa  41.2  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1998  hypothetical protein  31.34 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.846621  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4092  XRE family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 263 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5476  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 290 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1931  XRE family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 88 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>