30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1981 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1981  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 237 aa  478  1e-134  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1662  XRE family transcriptional regulator  78.9 
 
 		 242 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.126051  hitchhiker  0.00273483 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0689  XRE family transcriptional regulator  79.75 
 
 		 237 aa  402  1e-111  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0589  helix-turn-helix domain-containing protein  77.45 
 
 		 239 aa  375  1e-103  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1149  helix-turn-helix domain-containing protein  51.71 
 
 		 243 aa  255  5e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.475219 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  56.3 
 
 		 248 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0552  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 246 aa  191  6e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1931  XRE family transcriptional regulator  43.78 
 
 		 246 aa  191  9e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.380591  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0457  helix-turn-helix domain-containing protein  42.55 
 
 		 229 aa  188  8e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.335495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0380  helix-turn-helix domain-containing protein  42.55 
 
 		 229 aa  188  8e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1462  XRE family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0019  helix-turn-helix domain-containing protein  40.77 
 
 		 275 aa  185  6e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0525  helix-turn-helix domain-containing protein  40.85 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2360  helix-turn-helix domain-containing protein  41.88 
 
 		 236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0152  XRE family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1389  XRE family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0718  transcriptional regulator, XRE family  42.92 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2511  transcriptional regulator, XRE family  39.83 
 
 		 236 aa  166  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122746  normal  0.67505 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1628  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0158  helix-turn-helix domain-containing protein  37.61 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1744  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.571892  normal  0.738269 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2767  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 236 aa  157  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0721  transcriptional regulator, XRE family  38.26 
 
 		 236 aa  155  5.0000000000000005e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1598  helix-turn-helix domain-containing protein  39.74 
 
 		 241 aa  154  2e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.141613 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2056  transcriptional regulator, XRE family  36.96 
 
 		 236 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1971  transcriptional regulator, XRE family  35.56 
 
 		 233 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0813704 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1363  transcriptional regulator, XRE family  35.53 
 
 		 241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0763  XRE family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 91 aa  42.7  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3349  XRE family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 115 aa  42.4  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.185008 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3501  helix-turn-helix domain-containing protein  33.85 
 
 		 329 aa  42.4  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>