194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0763 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0763  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 91 aa  183  8e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1361  transcriptional regulator, XRE family  60.44 
 
 		 93 aa  118  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1165  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre family  45.45 
 
 		 94 aa  82.4  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000604987 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4023  transcriptional regulator, XRE family  42.7 
 
 		 94 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0593  transcriptional regulator, XRE family  43.9 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0244812  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0074  hypothetical protein  44.94 
 
 		 94 aa  78.2  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2787  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 99 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0601  transcriptional regulator, XRE family  43.9 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0870  transcriptional regulator, XRE family  46.34 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0315  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 117 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0773865 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0834  XRE family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.259279 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1031  transcriptional regulator, XRE family  45.35 
 
 		 89 aa  75.1  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000313321  normal  0.707924 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3859  transcriptional regulator, XRE family  51.35 
 
 		 93 aa  73.6  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0084  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1724  transcriptional regulator, XRE family  44.16 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5447  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 103 aa  68.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3174  XRE family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 98 aa  67.8  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00826056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0928  DNA polymerase III delta prime subunit  46.27 
 
 		 90 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1138  transcriptional regulator, XRE family  44.05 
 
 		 90 aa  65.1  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.4972  normal  0.249316 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2529  transcriptional regulator, XRE family  43.18 
 
 		 93 aa  65.1  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000784971  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0364  XRE family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 100 aa  64.7  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000740846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1336  XRE family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40166 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2564  XRE family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2735  XRE family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3411  XRE family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0658  XRE family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8282  putative transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145655  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1829  transcriptional regulator, XRE family  36.47 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3620  transcriptional regulator, XRE family  35.23 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494695  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1124  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.969354  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0117  putative DNA-binding protein  44.05 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197061  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3276  hypothetical protein  44.32 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2042  putative cytochrome c  41.54 
 
 		 90 aa  60.5  0.000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2419  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0889  putative transcriptional regulator, XRE family  35.23 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2243  transcriptional regulator, XRE family  38.27 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1535  transcriptional regulator, LacI family  44.83 
 
 		 465 aa  54.3  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  decreased coverage  0.00974115 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0282  transcriptional regulator, XRE family  32.95 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01487  phage N15 gp48-like protein  31.46 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.497667  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4582  transcriptional regulator, XRE family  34.21 
 
 		 99 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.752323 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01498  hypothetical protein  31.46 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0827  XRE family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.551431  normal  0.496549 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3540  transcriptional regulator, XRE family  31.82 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1542  hypothetical protein  42.19 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2319  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0017  transcriptional regulator, XRE family  34.83 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3260  transcriptional regulator, XRE family  54.17 
 
 		 513 aa  51.6  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0795644  normal  0.23679 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0807  helix-turn-helix domain-containing protein  36.36 
 
 		 94 aa  51.2  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0099  DNA-binding protein  34.52 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4157  XRE family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.555179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5139  XRE family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0723  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000669172 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7086  transcriptional regulator, XRE family  32.94 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.633613  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0875  XRE family transcriptional regulator  44 
 
 		 77 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000023095  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0311  transcriptional regulator  32.97 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1879  DNA-binding protein  32.97 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1050  transcriptional regulator, XRE family  48.08 
 
 		 184 aa  48.1  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000995235  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2743  transcriptional regulator, XRE family  44.68 
 
 		 180 aa  48.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  32.35 
 
 		 374 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17690  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  42.11 
 
 		 517 aa  47.8  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.356525  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  32.35 
 
 		 374 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3280  XRE family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 95 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.843876 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2775  transcriptional regulator, XRE family  45.65 
 
 		 180 aa  47.8  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  32.35 
 
 		 374 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  32.35 
 
 		 374 aa  47.4  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  32.35 
 
 		 374 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0538  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 202 aa  47  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1361  EPSP synthase (3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase)  41.38 
 
 		 516 aa  47  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419571  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0039  DNA-binding protein  32.14 
 
 		 95 aa  47  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.514774  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 76 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0930  transcriptional regulator  34.25 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00205943  normal  0.115025 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  32.35 
 
 		 374 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0189  XRE family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0195  helix-turn-helix domain-containing protein  38.78 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0744  DNA-binding protein  32.05 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2079  XRE family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 186 aa  45.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0185194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3411  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 		 183 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1565  transcriptional regulator, XRE family  41.51 
 
 		 179 aa  45.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 242 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0548  DNA-binding protein  41.51 
 
 		 67 aa  44.7  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1886  DNA-binding protein  39.62 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3130  transcriptional regulator  39.62 
 
 		 67 aa  44.7  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13300  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  50 
 
 		 509 aa  44.7  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.801467  normal  0.209244 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1291  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 184 aa  44.7  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0600797  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3354  transcriptional regulator, XRE family  41.51 
 
 		 179 aa  44.3  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.604997  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3505  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_489  DNA-binding protein  41.51 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.140066  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 374 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4003  transcriptional regulator, XRE family  44.68 
 
 		 61 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4608  DNA-binding protein  38.78 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.138106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0729  DNA-binding protein  38.78 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0764  DNA-binding protein  38.78 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0661  DNA-binding protein  38.78 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0605  transcriptional regulator  38.78 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.769041  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0750  DNA-binding protein  38.78 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000884285 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0512  XRE family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 185 aa  43.9  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0823  DNA-binding protein  38.78 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0103184  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1824  XRE family transcriptional regulator  42 
 
 		 117 aa  43.9  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0610  XRE family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081465  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3066  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0121825  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>