28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0525 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0525  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 
229 aa  464  9.999999999999999e-131  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1462  XRE family transcriptional regulator  89.96 
 
 
229 aa  432  1e-120  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0457  helix-turn-helix domain-containing protein  90.39 
 
 
229 aa  433  1e-120  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.335495  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0380  helix-turn-helix domain-containing protein  89.96 
 
 
229 aa  432  1e-120  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0019  helix-turn-helix domain-containing protein  68.56 
 
 
275 aa  330  1e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0718  transcriptional regulator, XRE family  51.13 
 
 
224 aa  218  7e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0552  XRE family transcriptional regulator  45.61 
 
 
246 aa  202  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1931  XRE family transcriptional regulator  47.39 
 
 
246 aa  201  7e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.380591  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1389  XRE family transcriptional regulator  46.26 
 
 
239 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0158  helix-turn-helix domain-containing protein  44.74 
 
 
236 aa  194  1e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1628  XRE family transcriptional regulator  44.59 
 
 
236 aa  192  3e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2360  helix-turn-helix domain-containing protein  43.86 
 
 
236 aa  191  1e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  39.74 
 
 
248 aa  185  5e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0152  XRE family transcriptional regulator  41.48 
 
 
236 aa  184  8e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1981  helix-turn-helix domain-containing protein  40.85 
 
 
237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323188  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0689  XRE family transcriptional regulator  40.85 
 
 
237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1662  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 
242 aa  177  1e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.126051  hitchhiker  0.00273483 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0589  helix-turn-helix domain-containing protein  40.34 
 
 
239 aa  177  2e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1744  transcriptional regulator, XRE family  42.42 
 
 
235 aa  176  3e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.571892  normal  0.738269 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2056  transcriptional regulator, XRE family  42.92 
 
 
236 aa  174  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2767  transcriptional regulator, XRE family  41.74 
 
 
236 aa  174  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1149  helix-turn-helix domain-containing protein  38.46 
 
 
243 aa  172  3.9999999999999995e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.475219 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1598  helix-turn-helix domain-containing protein  41.05 
 
 
241 aa  171  6.999999999999999e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.141613 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1363  transcriptional regulator, XRE family  40.17 
 
 
241 aa  171  9e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2511  transcriptional regulator, XRE family  39.04 
 
 
236 aa  170  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122746  normal  0.67505 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1971  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 
233 aa  167  2e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0813704 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0721  transcriptional regulator, XRE family  40.89 
 
 
236 aa  162  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2484  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 
67 aa  42.4  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>