29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2056 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2056  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 236 aa  468  1.0000000000000001e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0721  transcriptional regulator, XRE family  85.17 
 
 		 236 aa  404  1.0000000000000001e-112  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1971  transcriptional regulator, XRE family  75.98 
 
 		 233 aa  359  2e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0813704 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1744  transcriptional regulator, XRE family  71.18 
 
 		 235 aa  336  1.9999999999999998e-91  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.571892  normal  0.738269 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2767  transcriptional regulator, XRE family  65.65 
 
 		 236 aa  316  2e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2511  transcriptional regulator, XRE family  47.84 
 
 		 236 aa  218  5e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122746  normal  0.67505 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1389  XRE family transcriptional regulator  52.58 
 
 		 239 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0552  XRE family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 246 aa  209  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1628  XRE family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 236 aa  209  4e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2360  helix-turn-helix domain-containing protein  46.96 
 
 		 236 aa  207  8e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0152  XRE family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 236 aa  207  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1931  XRE family transcriptional regulator  47.84 
 
 		 246 aa  205  4e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.380591  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0158  helix-turn-helix domain-containing protein  44.74 
 
 		 236 aa  199  5e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0718  transcriptional regulator, XRE family  47.71 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0525  helix-turn-helix domain-containing protein  42.92 
 
 		 229 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0457  helix-turn-helix domain-containing protein  40.27 
 
 		 229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.335495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0380  helix-turn-helix domain-containing protein  40.27 
 
 		 229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1462  XRE family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 229 aa  172  5e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0019  helix-turn-helix domain-containing protein  39.73 
 
 		 275 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  38.89 
 
 		 248 aa  161  8.000000000000001e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0589  helix-turn-helix domain-containing protein  39.57 
 
 		 239 aa  161  9e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1149  helix-turn-helix domain-containing protein  37.77 
 
 		 243 aa  158  6e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.475219 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1662  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 242 aa  156  3e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.126051  hitchhiker  0.00273483 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1981  helix-turn-helix domain-containing protein  36.96 
 
 		 237 aa  154  2e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0689  XRE family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 237 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1598  helix-turn-helix domain-containing protein  40.43 
 
 		 241 aa  146  2.0000000000000003e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.141613 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1363  transcriptional regulator, XRE family  36.62 
 
 		 241 aa  139  4.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1438  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 284 aa  42.7  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.161381  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0155  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 83 aa  41.6  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.540606  hitchhiker  0.00139635 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>