31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1598 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1598  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 241 aa  485  1e-136  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.141613 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1363  transcriptional regulator, XRE family  59.48 
 
 		 241 aa  299  3e-80  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0525  helix-turn-helix domain-containing protein  41.05 
 
 		 229 aa  171  6.999999999999999e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0457  helix-turn-helix domain-containing protein  40.17 
 
 		 229 aa  169  3e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.335495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0380  helix-turn-helix domain-containing protein  40.17 
 
 		 229 aa  169  3e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1462  XRE family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 229 aa  168  9e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0718  transcriptional regulator, XRE family  42.51 
 
 		 224 aa  161  1e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0019  helix-turn-helix domain-containing protein  36.91 
 
 		 275 aa  158  6e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  37.8 
 
 		 248 aa  153  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1981  helix-turn-helix domain-containing protein  39.74 
 
 		 237 aa  154  2e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1662  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 242 aa  151  8.999999999999999e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.126051  hitchhiker  0.00273483 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1389  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 239 aa  151  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0689  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0152  XRE family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 236 aa  148  6e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2056  transcriptional regulator, XRE family  40.43 
 
 		 236 aa  146  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2360  helix-turn-helix domain-containing protein  35.59 
 
 		 236 aa  146  3e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1971  transcriptional regulator, XRE family  35.22 
 
 		 233 aa  143  3e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0813704 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0721  transcriptional regulator, XRE family  38.16 
 
 		 236 aa  142  4e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1628  XRE family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 236 aa  142  5e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0589  helix-turn-helix domain-containing protein  36.09 
 
 		 239 aa  142  6e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0552  XRE family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 246 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1149  helix-turn-helix domain-containing protein  34.32 
 
 		 243 aa  139  4.999999999999999e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.475219 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1744  transcriptional regulator, XRE family  35.81 
 
 		 235 aa  138  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.571892  normal  0.738269 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1931  XRE family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 246 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.380591  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2767  transcriptional regulator, XRE family  38.95 
 
 		 236 aa  132  6e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0158  helix-turn-helix domain-containing protein  33.19 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2511  transcriptional regulator, XRE family  31.82 
 
 		 236 aa  128  8.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122746  normal  0.67505 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2293  XRE family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 184 aa  47  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.351634 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0955  XRE family transcriptional regulator  34 
 
 		 232 aa  43.5  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 137 aa  42  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  34.69 
 
 		 206 aa  42  0.008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>