27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0158 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0158  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 236 aa  488  1e-137  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2360  helix-turn-helix domain-containing protein  70.76 
 
 		 236 aa  357  9.999999999999999e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2511  transcriptional regulator, XRE family  69.49 
 
 		 236 aa  351  5e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122746  normal  0.67505 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1628  XRE family transcriptional regulator  66.1 
 
 		 236 aa  333  1e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0152  XRE family transcriptional regulator  63.14 
 
 		 236 aa  317  7e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1931  XRE family transcriptional regulator  53.71 
 
 		 246 aa  251  9.000000000000001e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.380591  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0552  XRE family transcriptional regulator  51.3 
 
 		 246 aa  245  4e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1389  XRE family transcriptional regulator  52.29 
 
 		 239 aa  223  3e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1744  transcriptional regulator, XRE family  44.21 
 
 		 235 aa  207  8e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.571892  normal  0.738269 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0721  transcriptional regulator, XRE family  44.74 
 
 		 236 aa  199  3e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0380  helix-turn-helix domain-containing protein  45.61 
 
 		 229 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0457  helix-turn-helix domain-containing protein  45.61 
 
 		 229 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.335495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2056  transcriptional regulator, XRE family  44.74 
 
 		 236 aa  199  5e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1971  transcriptional regulator, XRE family  41.74 
 
 		 233 aa  198  7.999999999999999e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0813704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1462  XRE family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 229 aa  196  3e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2767  transcriptional regulator, XRE family  41.48 
 
 		 236 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0525  helix-turn-helix domain-containing protein  44.74 
 
 		 229 aa  194  1e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0019  helix-turn-helix domain-containing protein  40.85 
 
 		 275 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0718  transcriptional regulator, XRE family  41.85 
 
 		 224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0689  XRE family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1662  XRE family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 242 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.126051  hitchhiker  0.00273483 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1981  helix-turn-helix domain-containing protein  37.61 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0589  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1149  helix-turn-helix domain-containing protein  36.21 
 
 		 243 aa  154  8e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.475219 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  34.47 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1598  helix-turn-helix domain-containing protein  33.19 
 
 		 241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.141613 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1363  transcriptional regulator, XRE family  29.79 
 
 		 241 aa  115  6e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>