66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2034 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_2034  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 83 aa  169  9e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.194194 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0567  XRE family transcriptional regulator  54.22 
 
 		 82 aa  95.5  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.102591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4032  helix-turn-helix domain protein  48.19 
 
 		 83 aa  87.8  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.964235  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4245  helix-turn-helix domain protein  45.24 
 
 		 84 aa  87  9e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3847  helix-turn-helix domain-containing protein  43.16 
 
 		 93 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0065  hypothetical protein  44.3 
 
 		 79 aa  79  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4613  helix-turn-helix domain protein  44.05 
 
 		 89 aa  78.6  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.590277  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0496  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0306  transciptional regulator  41.94 
 
 		 93 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.93162  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0378  helix-turn-helix domain-containing protein  40.86 
 
 		 93 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0365  helix-turn-helix domain-containing protein  40.86 
 
 		 93 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0367  XRE family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 93 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1709  DNA-binding transcriptional regulator HipB  43.06 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1591  DNA-binding transcriptional regulator HipB  43.06 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2138  transcriptional regulator, XRE family  43.06 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0287483  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2149  DNA-binding transcriptional regulator HipB  43.06 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01480  hypothetical protein  43.06 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01470  DNA-binding transcriptional regulator  43.06 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003247  putative transcription regulator protein  46.97 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1801  DNA-binding transcriptional regulator HipB  43.06 
 
 		 83 aa  61.6  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1915  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 80 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.799088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2898  transcriptional regulator, XRE family  40.26 
 
 		 83 aa  60.5  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1476  XRE family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 91 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11984  transcriptional regulator  47.46 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2442  XRE family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001517  predicted transcriptional regulator  39.71 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000562754  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2003  HipB domain-containing protein  45.16 
 
 		 134 aa  52  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0155  XRE family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 83 aa  52  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.540606  hitchhiker  0.00139635 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1592  HipB domain-containing protein  45.16 
 
 		 134 aa  52  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0681  putative transcriptionl regulator HipB  45.16 
 
 		 134 aa  52  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2151  putative transcriptionl regulator HipB  45.16 
 
 		 136 aa  52  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.690845  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2236  putative transcriptionl regulator HipB  45.16 
 
 		 136 aa  52  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.74282  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0634  HipB domain-containing protein  45.16 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.29949  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1505  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.139126  normal  0.0361039 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0789  HipB domain-containing protein  45.16 
 
 		 155 aa  50.8  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107176  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5634  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909222  normal  0.150315 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6085  transcriptional regulator, XRE family  30.86 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815218  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3331  putative transcription regulator protein  39.24 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4813  putative transcriptionl regulator HipB  43.75 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5530  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 162 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0171722 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1252  putative transcription regulator protein  40.32 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3701  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8282  putative transcriptional regulator, XRE family  42.42 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145655  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0889  putative transcriptional regulator, XRE family  43.1 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3946  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.87 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4224  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3620  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494695  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1872  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 115 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.765913  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3478  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 115 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0017  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 134 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4574  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000193925 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3350  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3247  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5447  XRE family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2577  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0918178  hitchhiker  0.000133769 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2611  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0796411  hitchhiker  0.0000000000000114 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3380  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.738813  hitchhiker  0.00256975 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3970  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4397  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5958  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1622  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00320147  normal  0.504339 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  36.54 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3484  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 200 aa  40.4  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2176  transcriptional regulator, XRE family  31.67 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1031  transcriptional regulator, XRE family  36 
 
 		 89 aa  40.4  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000313321  normal  0.707924 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3103  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 		 503 aa  40.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>