70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1622 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1622  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 142 aa  279  7.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00320147  normal  0.504339 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5958  XRE family transcriptional regulator  69.72 
 
 		 134 aa  174  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4397  XRE family transcriptional regulator  69.01 
 
 		 135 aa  150  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3970  XRE family transcriptional regulator  69.01 
 
 		 135 aa  150  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4276  XRE family transcriptional regulator  62.16 
 
 		 145 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3808  XRE family transcriptional regulator  59.06 
 
 		 145 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.57528 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4224  XRE family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 161 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5530  XRE family transcriptional regulator  52.21 
 
 		 162 aa  104  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0171722 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1365  XRE family transcriptional regulator  69.12 
 
 		 173 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.927865 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3701  transcriptional regulator, XRE family  52.08 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1592  HipB domain-containing protein  62.34 
 
 		 134 aa  98.6  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2003  HipB domain-containing protein  62.34 
 
 		 134 aa  98.6  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2236  putative transcriptionl regulator HipB  69.7 
 
 		 136 aa  98.6  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.74282  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2151  putative transcriptionl regulator HipB  69.7 
 
 		 136 aa  98.6  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.690845  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0681  putative transcriptionl regulator HipB  62.34 
 
 		 134 aa  98.6  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4813  putative transcriptionl regulator HipB  59.72 
 
 		 101 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0634  HipB domain-containing protein  69.7 
 
 		 136 aa  97.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.29949  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0789  HipB domain-containing protein  60 
 
 		 155 aa  89.4  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107176  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3331  putative transcription regulator protein  53.75 
 
 		 94 aa  73.6  0.0000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0338  XRE family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 171 aa  72  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.329907 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1252  putative transcription regulator protein  49.38 
 
 		 88 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4519  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0094  transcriptional regulator, XRE family  46.88 
 
 		 85 aa  61.2  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.850445  normal  0.0181777 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1447  putative transcription regulator protein  50.85 
 
 		 84 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2611  XRE family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0796411  hitchhiker  0.0000000000000114 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2577  XRE family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0918178  hitchhiker  0.000133769 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3946  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  38.98 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6085  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815218  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1915  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 80 aa  51.6  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.799088  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01487  phage N15 gp48-like protein  39.34 
 
 		 94 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.497667  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01498  hypothetical protein  39.34 
 
 		 94 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1344  XRE family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 258 aa  50.4  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.388374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1505  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.139126  normal  0.0361039 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3540  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 94 aa  47  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0282  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 94 aa  47  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5634  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 82 aa  47  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909222  normal  0.150315 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3754  helix-turn-helix domain protein  48.78 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01470  DNA-binding transcriptional regulator  34.43 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1709  DNA-binding transcriptional regulator HipB  34.43 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1542  hypothetical protein  38.89 
 
 		 102 aa  46.2  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2138  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0287483  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2149  DNA-binding transcriptional regulator HipB  34.43 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01480  hypothetical protein  34.43 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1591  DNA-binding transcriptional regulator HipB  34.43 
 
 		 94 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0367  XRE family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0365  helix-turn-helix domain-containing protein  30.38 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0378  helix-turn-helix domain-containing protein  30.38 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 68 aa  44.7  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1635  transcriptional regulator, XRE family  43.14 
 
 		 112 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1451  helix-turn-helix domain-containing protein  32.84 
 
 		 127 aa  44.7  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1496  XRE family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0143  transcriptional regulator, XRE family  31.82 
 
 		 825 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.514651 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1801  DNA-binding transcriptional regulator HipB  35.59 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0777  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000109093  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5270  putative XRE family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.365814 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0306  transciptional regulator  32.2 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.93162  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0496  XRE family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 103 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11300  predicted transcriptional regulator  27.91 
 
 		 197 aa  42  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.352927 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0551  transcriptional regulator, XRE family  32.39 
 
 		 210 aa  42  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.401249  hitchhiker  0.0000933135 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0744  DNA-binding protein  34.55 
 
 		 95 aa  41.2  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0543  helix-turn-helix domain protein  40 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1266  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.119071 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65950  putative transcriptional regulator  39.74 
 
 		 199 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3260  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 513 aa  41.2  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0795644  normal  0.23679 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2922  transcriptional regulator, XRE family  45.28 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.562834  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0010  DNA-binding protein  38.18 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.235299  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3847  helix-turn-helix domain-containing protein  28.81 
 
 		 93 aa  40.8  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0677  XRE family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 276 aa  40.8  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.244102  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2034  XRE family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.194194 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0627  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.845219  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>