44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1365 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1365  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 173 aa  339  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.927865 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2151  putative transcriptionl regulator HipB  67.47 
 
 		 136 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.690845  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2236  putative transcriptionl regulator HipB  67.47 
 
 		 136 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.74282  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0634  HipB domain-containing protein  67.47 
 
 		 136 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.29949  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0681  putative transcriptionl regulator HipB  67.47 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1592  HipB domain-containing protein  67.47 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5530  XRE family transcriptional regulator  67.14 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0171722 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2003  HipB domain-containing protein  67.47 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4224  XRE family transcriptional regulator  72.06 
 
 		 161 aa  108  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5958  XRE family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 134 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3808  XRE family transcriptional regulator  70.59 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.57528 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4276  XRE family transcriptional regulator  70.59 
 
 		 145 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1622  XRE family transcriptional regulator  69.12 
 
 		 142 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00320147  normal  0.504339 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0789  HipB domain-containing protein  66.2 
 
 		 155 aa  99.8  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107176  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3970  XRE family transcriptional regulator  45.11 
 
 		 135 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4397  XRE family transcriptional regulator  45.11 
 
 		 135 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3701  transcriptional regulator, XRE family  65.67 
 
 		 101 aa  94.7  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4813  putative transcriptionl regulator HipB  62.69 
 
 		 101 aa  91.3  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3331  putative transcription regulator protein  54.22 
 
 		 94 aa  76.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0338  XRE family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 171 aa  70.5  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.329907 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4519  XRE family transcriptional regulator  53.03 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2611  XRE family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0796411  hitchhiker  0.0000000000000114 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2577  XRE family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0918178  hitchhiker  0.000133769 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0094  transcriptional regulator, XRE family  42.47 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.850445  normal  0.0181777 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1252  putative transcription regulator protein  43.75 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3946  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  36.49 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1915  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 80 aa  50.4  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.799088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6085  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 85 aa  48.9  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815218  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5270  putative XRE family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.365814 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0378  helix-turn-helix domain-containing protein  37.29 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0365  helix-turn-helix domain-containing protein  37.29 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0367  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 93 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0306  transciptional regulator  37.29 
 
 		 93 aa  45.4  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.93162  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1709  DNA-binding transcriptional regulator HipB  28.57 
 
 		 94 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0143  transcriptional regulator, XRE family  35.14 
 
 		 825 aa  44.7  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.514651 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1447  putative transcription regulator protein  40.68 
 
 		 84 aa  44.7  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4032  helix-turn-helix domain protein  33.9 
 
 		 83 aa  43.9  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.964235  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3847  helix-turn-helix domain-containing protein  33.9 
 
 		 93 aa  43.5  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3260  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 513 aa  42.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0795644  normal  0.23679 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0496  XRE family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 103 aa  42.4  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4245  helix-turn-helix domain protein  30.26 
 
 		 84 aa  41.2  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5634  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 82 aa  41.2  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909222  normal  0.150315 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0935  hypothetical protein  32.2 
 
 		 143 aa  41.2  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0169  Cro/CI family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 68 aa  40.8  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0106537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>