52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1635 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1635  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 112 aa  229  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3278  hypothetical protein  51.3 
 
 		 110 aa  101  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.397996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3331  XRE family transcriptional regulator  53 
 
 		 109 aa  100  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.925348  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0666  XRE family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1647  DNA-binding protein  39 
 
 		 115 aa  79.3  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.68181  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5722  putative transcriptional regulator  45 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1786  helix-turn-helix transcriptional regulator  35 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0887  helix-turn-helix DNA binding domain-containing protein  39.18 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3858  helix-turn-helix DNA binding domain-containing protein  39.18 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.793488  normal  0.0443892 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4149  helix-turn-helix DNA binding domain-containing protein  38.14 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00609324  hitchhiker  0.00863395 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1221  XRE family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0405  transcriptional regulator, XRE family  32.5 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.267838  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0535  transcriptional regulator  31.75 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00965435  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1132  XRE family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0986  transcriptional regulator, XRE family  28.8 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5702  transcriptional regulator, XRE family  31.43 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4742  transcriptional regulator, XRE family  39.08 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0122495 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2542  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  51.2  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2268  XRE family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 201 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.924655  normal  0.398688 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3970  XRE family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4397  XRE family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1730  transcriptional regulator, XRE family  47.17 
 
 		 184 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0681  putative transcriptionl regulator HipB  44.44 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1592  HipB domain-containing protein  44.44 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2003  HipB domain-containing protein  44.44 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3808  XRE family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.57528 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2151  putative transcriptionl regulator HipB  44.44 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.690845  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4276  XRE family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0512  XRE family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 185 aa  45.1  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2236  putative transcriptionl regulator HipB  44.44 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.74282  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4224  XRE family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 161 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0634  HipB domain-containing protein  44.44 
 
 		 136 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.29949  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1622  XRE family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 142 aa  44.3  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00320147  normal  0.504339 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0789  HipB domain-containing protein  34.57 
 
 		 155 aa  44.3  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107176  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1574  XRE family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 184 aa  44.3  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.844747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2666  XRE family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 86 aa  43.9  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.355164  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0273  transcriptional regulator, XRE family  31.94 
 
 		 115 aa  42.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2079  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0185194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2293  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 184 aa  43.5  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.351634 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5958  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2775  transcriptional regulator, XRE family  43.14 
 
 		 180 aa  42.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0604  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 138 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5530  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0171722 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0868  XRE family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 263 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.471001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2743  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 180 aa  41.2  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6629  putative Phage-related transcriptional regulator  35.09 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3701  transcriptional regulator, XRE family  40.38 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17690  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  42.55 
 
 		 517 aa  40.8  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.356525  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1365  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 173 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.927865 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1676  gp68  32.52 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610076  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0763  XRE family transcriptional regulator  42 
 
 		 91 aa  40  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2922  transcriptional regulator, XRE family  46.81 
 
 		 102 aa  40  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.562834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>