63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1505 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1505  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 87 aa  174  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.139126  normal  0.0361039 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5916  XRE family transcriptional regulator  62.35 
 
 		 87 aa  103  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5634  XRE family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 82 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909222  normal  0.150315 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6085  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815218  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1915  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 80 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.799088  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1447  putative transcription regulator protein  46.88 
 
 		 84 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4902  transcriptional regulator, XRE family  42.5 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.173853  normal  0.0865423 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3946  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  42.03 
 
 		 91 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3754  helix-turn-helix domain protein  50 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2034  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 83 aa  50.8  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.194194 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0094  transcriptional regulator, XRE family  32.93 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.850445  normal  0.0181777 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3339  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 733 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0065  hypothetical protein  36.84 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1252  putative transcription regulator protein  40.58 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3701  transcriptional regulator, XRE family  36.49 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3970  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4397  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1622  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 142 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00320147  normal  0.504339 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5270  putative XRE family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 101 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.365814 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4813  putative transcriptionl regulator HipB  36.49 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0367  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3331  putative transcription regulator protein  38.89 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0496  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4613  helix-turn-helix domain protein  32.43 
 
 		 89 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.590277  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4224  XRE family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3847  helix-turn-helix domain-containing protein  32.86 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5958  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0365  helix-turn-helix domain-containing protein  35.29 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0306  transciptional regulator  35.29 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.93162  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0378  helix-turn-helix domain-containing protein  35.29 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3808  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.57528 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4276  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4519  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 168 aa  43.9  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0567  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.102591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0127  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0983  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.525138  normal  0.0218109 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1709  DNA-binding transcriptional regulator HipB  25.32 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01480  hypothetical protein  25.32 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01498  hypothetical protein  35.59 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 169 aa  42.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2149  DNA-binding transcriptional regulator HipB  25.32 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17084  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01470  DNA-binding transcriptional regulator  25.32 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1591  DNA-binding transcriptional regulator HipB  25.32 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2138  transcriptional regulator, XRE family  25.32 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0287483  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01487  phage N15 gp48-like protein  35.59 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.497667  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3722  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 103 aa  41.6  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0676164  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4003  DNA-binding protein  34.62 
 
 		 103 aa  41.6  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3588  DNA-binding protein  34.62 
 
 		 103 aa  41.6  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0627  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 101 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.845219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0155  XRE family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 83 aa  41.6  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.540606  hitchhiker  0.00139635 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0338  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 171 aa  41.2  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.329907 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1451  helix-turn-helix domain-containing protein  31.67 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0820  transcriptional regulator, XRE family  35.14 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0102782 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2577  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0918178  hitchhiker  0.000133769 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0282  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3540  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1496  XRE family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2611  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0796411  hitchhiker  0.0000000000000114 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0143  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 825 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.514651 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2260  transcriptional regulator, XRE family  32.84 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003247  putative transcription regulator protein  35.29 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3808  XRE family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 80 aa  40.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0020912  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0715  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 		 187 aa  40.4  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.39864  normal  0.0327391 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>