56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0338 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0338  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 171 aa  343  5e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.329907 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4519  XRE family transcriptional regulator  73.37 
 
 		 168 aa  234  4e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1447  putative transcription regulator protein  61.67 
 
 		 84 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2577  XRE family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0918178  hitchhiker  0.000133769 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2611  XRE family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0796411  hitchhiker  0.0000000000000114 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1365  XRE family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.927865 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5530  XRE family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0171722 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3970  XRE family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 135 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4397  XRE family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 135 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4224  XRE family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5958  XRE family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1622  XRE family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00320147  normal  0.504339 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4276  XRE family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3808  XRE family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.57528 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0789  HipB domain-containing protein  48.53 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107176  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3331  putative transcription regulator protein  48.53 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0634  HipB domain-containing protein  47.06 
 
 		 136 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.29949  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3701  transcriptional regulator, XRE family  32.69 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0681  putative transcriptionl regulator HipB  47.06 
 
 		 134 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2151  putative transcriptionl regulator HipB  47.06 
 
 		 136 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.690845  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2236  putative transcriptionl regulator HipB  47.06 
 
 		 136 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.74282  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2003  HipB domain-containing protein  47.06 
 
 		 134 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1592  HipB domain-containing protein  47.06 
 
 		 134 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1801  DNA-binding transcriptional regulator HipB  31.94 
 
 		 83 aa  51.2  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4302  transcriptional regulator, XRE family  40.38 
 
 		 79 aa  51.2  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.397769  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01480  hypothetical protein  32.39 
 
 		 88 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2138  transcriptional regulator, XRE family  32.39 
 
 		 88 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0287483  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2149  DNA-binding transcriptional regulator HipB  32.39 
 
 		 88 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4813  putative transcriptionl regulator HipB  35.71 
 
 		 101 aa  50.8  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1709  DNA-binding transcriptional regulator HipB  32.39 
 
 		 94 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1591  DNA-binding transcriptional regulator HipB  32.39 
 
 		 94 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01470  DNA-binding transcriptional regulator  32.39 
 
 		 88 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2410  transcriptional regulator, XRE family  38.37 
 
 		 141 aa  50.4  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000774173  normal  0.481646 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1916  transcriptional regulator, XRE family  40.38 
 
 		 104 aa  50.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193475  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003247  putative transcription regulator protein  34.72 
 
 		 88 aa  49.3  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3946  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  35.21 
 
 		 91 aa  48.1  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1252  putative transcription regulator protein  31.91 
 
 		 88 aa  47.8  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6085  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 85 aa  47  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815218  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0914  XRE family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1719  transcriptional regulator, XRE family  34.55 
 
 		 104 aa  44.7  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.134789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0094  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 85 aa  43.9  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.850445  normal  0.0181777 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1451  helix-turn-helix domain-containing protein  39.66 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  30.56 
 
 		 244 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0718  Cro/CI family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 264 aa  42.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0143  transcriptional regulator, XRE family  39.58 
 
 		 825 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.514651 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0496  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0726  Cro/CI family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 264 aa  42.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1496  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 110 aa  43.1  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3847  helix-turn-helix domain-containing protein  30.68 
 
 		 93 aa  42.4  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 101 aa  42  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5916  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 87 aa  41.6  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1505  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 87 aa  41.2  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.139126  normal  0.0361039 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1442  transcriptional regulator, XRE family  33.8 
 
 		 103 aa  41.2  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2161  helix-turn-helix domain-containing protein  33.82 
 
 		 126 aa  40.8  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6705  helix-turn-helix domain protein  35.85 
 
 		 292 aa  40.8  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 182 aa  40.8  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>