55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0496 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0496  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 103 aa  210  5.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3847  helix-turn-helix domain-containing protein  80.58 
 
 		 93 aa  156  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0306  transciptional regulator  72.82 
 
 		 93 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.93162  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0378  helix-turn-helix domain-containing protein  72.82 
 
 		 93 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0365  helix-turn-helix domain-containing protein  72.82 
 
 		 93 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0367  XRE family transcriptional regulator  69.9 
 
 		 93 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4613  helix-turn-helix domain protein  71.79 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.590277  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4245  helix-turn-helix domain protein  58.25 
 
 		 84 aa  108  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4032  helix-turn-helix domain protein  54.37 
 
 		 83 aa  103  8e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.964235  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2034  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 83 aa  78.6  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.194194 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0065  hypothetical protein  48.48 
 
 		 79 aa  74.3  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0567  XRE family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 82 aa  73.9  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.102591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1801  DNA-binding transcriptional regulator HipB  42.35 
 
 		 83 aa  70.5  0.000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003247  putative transcription regulator protein  46.27 
 
 		 88 aa  67.4  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1709  DNA-binding transcriptional regulator HipB  41.89 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1591  DNA-binding transcriptional regulator HipB  41.89 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01470  DNA-binding transcriptional regulator  41.89 
 
 		 88 aa  57  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2149  DNA-binding transcriptional regulator HipB  41.89 
 
 		 88 aa  57  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17084  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2138  transcriptional regulator, XRE family  41.89 
 
 		 88 aa  57  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0287483  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01480  hypothetical protein  41.89 
 
 		 88 aa  57  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2898  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1915  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 80 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.799088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1476  XRE family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5634  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909222  normal  0.150315 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6085  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815218  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0155  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.540606  hitchhiker  0.00139635 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2003  HipB domain-containing protein  38.98 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1592  HipB domain-containing protein  38.98 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0681  putative transcriptionl regulator HipB  38.98 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2151  putative transcriptionl regulator HipB  38.98 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.690845  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2236  putative transcriptionl regulator HipB  38.98 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.74282  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0634  HipB domain-containing protein  38.98 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.29949  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1252  putative transcription regulator protein  33.33 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0789  HipB domain-containing protein  37.29 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107176  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2442  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1447  putative transcription regulator protein  32.31 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0094  transcriptional regulator, XRE family  28.99 
 
 		 85 aa  47  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.850445  normal  0.0181777 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5916  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 87 aa  47  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11984  transcriptional regulator  36.76 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1505  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.139126  normal  0.0361039 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3701  transcriptional regulator, XRE family  27.17 
 
 		 101 aa  45.1  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5530  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 162 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0171722 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001517  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 84 aa  43.5  0.0009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000562754  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4519  XRE family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1365  XRE family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 173 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.927865 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0338  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.329907 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4224  XRE family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 161 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4397  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 135 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3970  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 135 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3100  transcriptional regulator, XRE family  32.76 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000473627  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1274  transcriptional regulator, XRE family  28.79 
 
 		 212 aa  40.8  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3331  putative transcription regulator protein  28.41 
 
 		 94 aa  40.4  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2176  transcriptional regulator, XRE family  32.76 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5958  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1622  XRE family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 142 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00320147  normal  0.504339 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>