80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1442 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1442  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 103 aa  210  5.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4562  transcriptional regulator, XRE family  58.43 
 
 		 98 aa  116  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00197637  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2042  putative cytochrome c  41.18 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0914  XRE family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1361  transcriptional regulator, XRE family  30.67 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5447  XRE family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0928  DNA polymerase III delta prime subunit  32.84 
 
 		 90 aa  47.8  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1138  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 90 aa  47  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.4972  normal  0.249316 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0650  XRE family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1386  XRE family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1165  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre family  29.73 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000604987 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1031  transcriptional regulator, XRE family  34.55 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000313321  normal  0.707924 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0791  transcriptional regulator, XRE family  33.71 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2079  XRE family transcriptional regulator  53.66 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0185194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1709  DNA-binding transcriptional regulator HipB  32.14 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1591  DNA-binding transcriptional regulator HipB  34.25 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4900  hypothetical protein  33.33 
 
 		 105 aa  45.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.978216  normal  0.040659 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2425  transcriptional regulator  40.32 
 
 		 99 aa  45.1  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0074  hypothetical protein  33.85 
 
 		 94 aa  45.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2293  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 184 aa  44.7  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.351634 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01480  hypothetical protein  35.48 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2149  DNA-binding transcriptional regulator HipB  35.48 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4032  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 187 aa  44.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.45676  normal  0.0335955 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2138  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0287483  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01470  DNA-binding transcriptional regulator  35.48 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1916  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193475  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4023  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0315  XRE family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0773865 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1565  transcriptional regulator, XRE family  47.83 
 
 		 179 aa  43.9  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 182 aa  42.7  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0538  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 202 aa  43.5  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3530  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.606022  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4302  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.397769  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1858  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1730  transcriptional regulator, XRE family  46 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2792  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3354  transcriptional regulator, XRE family  45.65 
 
 		 179 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.604997  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4384  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4162  XRE family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5640  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.731345  normal  0.328925 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 101 aa  42  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4519  XRE family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0572  cupin 2 domain-containing protein  36.21 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0503  transcriptional regulator, XRE family  28.79 
 
 		 194 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0483553 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31160  hypothetical protein  36.36 
 
 		 107 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000126154  unclonable  8.75499e-23 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1409  transcriptional regulator, XRE family  36.99 
 
 		 75 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.503834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0549  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 103 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  41.82 
 
 		 346 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1573  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 		 63 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0710  putative prophage repressor  34.69 
 
 		 245 aa  41.6  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1125  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2252  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00411497  normal  0.680338 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0478  XRE family transcriptional regulator  46 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1622  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4362  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0338  XRE family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 171 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.329907 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5696  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01954  hypothetical protein  33.85 
 
 		 221 aa  40.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3301  XRE family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 234 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04053  Transcriptional Regulator, XRE family protein  39.22 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1291  XRE family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 184 aa  40.4  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0600797  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40150  putative transcriptional regulator  38.98 
 
 		 183 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 182 aa  40.8  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2082  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3859  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 93 aa  40.4  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1888  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2775  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 180 aa  40.4  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2743  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 180 aa  40.4  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2125  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0658  XRE family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 95 aa  40.4  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1719  transcriptional regulator, XRE family  32.39 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.134789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3243  DNA-binding protein  40.74 
 
 		 69 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5087  XRE family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 78 aa  40.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000142264  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2934  helix-turn-helix family DNA-binding protein  40.74 
 
 		 69 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3012  DNA-binding protein  40.74 
 
 		 69 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.632687  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2646  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 182 aa  40.4  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2304  XRE family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 131 aa  40.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0985964 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1128  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 182 aa  40  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4019  XRE family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 72 aa  40  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0671372 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1058  XRE family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 184 aa  40  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>