273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1730 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1730  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 184 aa  369  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1574  XRE family transcriptional regulator  63.93 
 
 		 184 aa  240  7e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.844747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1291  XRE family transcriptional regulator  63.04 
 
 		 184 aa  231  3e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0600797  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0512  XRE family transcriptional regulator  48.63 
 
 		 185 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2079  XRE family transcriptional regulator  41.85 
 
 		 186 aa  152  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0185194  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0868  transcriptional regulator, XRE family  44.13 
 
 		 179 aa  148  5e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1565  transcriptional regulator, XRE family  39.67 
 
 		 179 aa  138  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3354  transcriptional regulator, XRE family  39.67 
 
 		 179 aa  137  6e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.604997  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2775  transcriptional regulator, XRE family  40.54 
 
 		 180 aa  134  6.0000000000000005e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2743  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 180 aa  133  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0538  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1050  transcriptional regulator, XRE family  35.91 
 
 		 184 aa  107  8.000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000995235  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2293  XRE family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 184 aa  99.8  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.351634 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0952  XRE family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0264927 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1634  CBS  38.53 
 
 		 457 aa  68.2  0.00000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0281  CBS  37.27 
 
 		 459 aa  67.4  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2553  Cysteine synthase  32.28 
 
 		 457 aa  62.8  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2126  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.36 
 
 		 457 aa  62.8  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2280  cysteine synthase  34.55 
 
 		 459 aa  61.2  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0438  cystathionine beta-synthase  31.17 
 
 		 455 aa  60.1  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1945  Cysteine synthase  33.94 
 
 		 457 aa  60.1  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  33.91 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  28.47 
 
 		 877 aa  59.7  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  32.23 
 
 		 888 aa  58.9  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4674  cystathionine beta-synthase  32.74 
 
 		 464 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202958 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  33.93 
 
 		 455 aa  58.5  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  28.3 
 
 		 769 aa  58.2  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4149  cystathionine beta-synthase  30.97 
 
 		 464 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0798519  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4224  cystathionine beta-synthase  30.97 
 
 		 464 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3378  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  28.38 
 
 		 461 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19393  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4380  cystathionine beta-synthase  30.97 
 
 		 464 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.558337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3442  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  28.38 
 
 		 461 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1048  cystathionine beta-synthase  31.58 
 
 		 455 aa  56.6  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1617  cystathionine beta-synthase  30.97 
 
 		 464 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1082  cystathionine beta-synthase  30.77 
 
 		 454 aa  57  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0083  cystathionine beta-synthase  31.11 
 
 		 458 aa  55.1  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2671  cystathionine beta-synthase  30.36 
 
 		 468 aa  54.7  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0943  cystathionine beta-synthase  30.09 
 
 		 454 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2043  cystathionine beta-synthase  30.09 
 
 		 464 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0700  cystathionine beta-synthase  30.09 
 
 		 456 aa  53.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2178  Cysteine synthase  32.73 
 
 		 466 aa  53.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0939  cystathionine beta-synthase  29.93 
 
 		 462 aa  53.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6424  cystathionine beta-synthase  28.8 
 
 		 463 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.510477  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0925  cystathionine beta-synthase  29.2 
 
 		 468 aa  52.8  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31890  cystathionine beta-synthase  27.21 
 
 		 457 aa  52  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.499085  normal  0.354911 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3152  cystathionine beta-synthase  28.32 
 
 		 460 aa  51.6  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676366  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3100  transcriptional regulator, XRE family  49.02 
 
 		 97 aa  51.6  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000473627  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2176  transcriptional regulator, XRE family  49.02 
 
 		 97 aa  51.6  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  28.08 
 
 		 348 aa  51.6  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4209  cystathionine beta-synthase  30.83 
 
 		 464 aa  51.2  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8566  cystathionine beta-synthase  30.36 
 
 		 456 aa  51.2  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1578  PolyA polymerase family protein  28.93 
 
 		 880 aa  50.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.507141  normal  0.242793 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2625  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 217 aa  50.4  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0855  cystathionine beta-synthase  29.73 
 
 		 456 aa  50.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  29.1 
 
 		 463 aa  49.7  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4384  transcriptional regulator, XRE family  44 
 
 		 108 aa  49.7  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3300  cystathionine beta-synthase  26.35 
 
 		 464 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1849  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.36 
 
 		 633 aa  49.7  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0912  cystathionine beta-synthase  30.63 
 
 		 456 aa  49.7  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1941  transcriptional regulator  44.23 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  25 
 
 		 226 aa  49.3  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 252 aa  49.3  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  28.68 
 
 		 208 aa  49.3  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  30.09 
 
 		 140 aa  49.3  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  28.78 
 
 		 230 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0644  cystathionine beta-synthase  28.32 
 
 		 463 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1297  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  26.81 
 
 		 888 aa  48.9  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.795106  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11095  cystathionine beta-synthase CBS  29.2 
 
 		 464 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000328093  normal  0.348251 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2536  CBS domain containing protein  30.19 
 
 		 153 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.55636  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  29.46 
 
 		 142 aa  48.9  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2632  CBS domain containing protein  29.36 
 
 		 153 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.231798  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  30.77 
 
 		 873 aa  48.9  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1647  DNA-binding protein  43.1 
 
 		 115 aa  48.5  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.68181  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  30.58 
 
 		 155 aa  48.9  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1323  XRE family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 153 aa  48.5  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805809  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 83 aa  48.5  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1434  Cysteine synthase  30.95 
 
 		 453 aa  48.5  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.700608 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3418  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 97 aa  48.1  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.961393 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  26.67 
 
 		 873 aa  48.1  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0787  cystathionine beta-synthase  31.19 
 
 		 454 aa  48.1  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40993  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  27.34 
 
 		 230 aa  47.8  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1058  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 184 aa  47.8  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  27.46 
 
 		 151 aa  47.8  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1535  transcriptional regulator, LacI family  49.09 
 
 		 465 aa  47  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  decreased coverage  0.00974115 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1972  CBS  28.78 
 
 		 898 aa  47  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.03578  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1558  putative transcriptional regulator, XRE family  28.8 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  27.83 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  27.73 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  43.86 
 
 		 255 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  25.58 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  26.14 
 
 		 903 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  23.58 
 
 		 258 aa  46.6  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  26.87 
 
 		 885 aa  46.6  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1136  DNA-binding protein  47.46 
 
 		 101 aa  45.8  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.632905  normal  0.0362151 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17600  cystathionine beta-synthase  31.86 
 
 		 521 aa  46.2  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  24.79 
 
 		 277 aa  45.8  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  41.51 
 
 		 256 aa  45.8  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  23.13 
 
 		 867 aa  46.2  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1182  putative transcriptional regulator, XRE family  22.86 
 
 		 147 aa  46.2  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000705125  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  27.73 
 
 		 907 aa  45.8  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>