51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2252 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1622  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 100 aa  197  3.9999999999999996e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2252  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 100 aa  197  3.9999999999999996e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00411497  normal  0.680338 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4900  hypothetical protein  53.06 
 
 		 105 aa  110  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.978216  normal  0.040659 
 
 
-
 
NC_003296  RS01906  hypothetical protein  44.26 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.610922  normal  0.293874 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4620  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.157225  normal  0.499919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4487  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.181354  normal  0.422127 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04053  Transcriptional Regulator, XRE family protein  31.52 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0549  transcriptional regulator, XRE family  33.77 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3922  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  40.98 
 
 		 118 aa  52  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4373  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00851296  normal  0.949544 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1125  XRE family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 104 aa  52  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0551  transcriptional regulator, XRE family  44.23 
 
 		 210 aa  49.7  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.401249  hitchhiker  0.0000933135 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  37.68 
 
 		 459 aa  47.8  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6814  transcriptional regulator, XRE family  32.56 
 
 		 102 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1291  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 184 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0600797  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  38.57 
 
 		 227 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1730  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 184 aa  45.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  46 
 
 		 346 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1416  transcriptional regulator, XRE family  47.46 
 
 		 77 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.239445  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4023  transcriptional regulator, XRE family  34.48 
 
 		 94 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1626  putative phage repressor  39.68 
 
 		 244 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2079  XRE family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 186 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0185194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  33.33 
 
 		 293 aa  43.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4570  XRE family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.27714 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3877  helix-turn-helix domain protein  38.46 
 
 		 383 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.862285 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2314  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 208 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.059917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3478  XRE family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 115 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3350  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 115 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3247  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 115 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1872  XRE family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 115 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.765913  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2231  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 190 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2319  transcriptional regulator, XRE family  27.63 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0568  transcriptional regulator, XRE family  32.69 
 
 		 304 aa  41.2  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.415819  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5912  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 213 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1442  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0868  transcriptional regulator, XRE family  45.83 
 
 		 179 aa  40.8  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0512  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 185 aa  40.8  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3722  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0676164  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4003  DNA-binding protein  39.13 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3588  DNA-binding protein  39.13 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5240  XRE family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 159 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5619  XRE family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 159 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.173792  normal  0.0387834 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2039  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 187 aa  40.8  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 198 aa  40.8  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4562  transcriptional regulator, XRE family  29.51 
 
 		 98 aa  40  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00197637  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2965  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 224 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4331  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 88 aa  40  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2371  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 165 aa  40  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111191  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1885  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 68 aa  40  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000259455 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0190  transcriptional regulator, XRE family  36.73 
 
 		 112 aa  40  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4036  transcriptional regulator, XRE family  31.03 
 
 		 84 aa  40  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610056  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>