27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5619 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_5240  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 159 aa  315  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5619  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 159 aa  315  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.173792  normal  0.0387834 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0072  XRE family transcriptional regulator  81.65 
 
 		 159 aa  236  8e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5848  transcriptional regulator, XRE family  42.94 
 
 		 176 aa  131  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5088  XRE family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 167 aa  95.9  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000165067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3385  XRE family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 169 aa  90.9  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0718  XRE family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 171 aa  86.3  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.764173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5036  XRE family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 166 aa  85.5  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3808  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 80 aa  58.9  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0020912  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0820  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 79 aa  57  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0102782 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1274  XRE family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.329441  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3687  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 		 79 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2047  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 83 aa  53.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6295  helix-turn-helix domain-containing protein  47.69 
 
 		 93 aa  48.9  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5431  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.716387  normal  0.867638 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0204  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3620  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494695  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0707  XRE family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1824  XRE family transcriptional regulator  54.05 
 
 		 117 aa  41.2  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0110  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2252  XRE family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00411497  normal  0.680338 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1622  transcriptional regulator, XRE family  47.92 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0617  hypothetical protein  46.15 
 
 		 71 aa  40.8  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455371  hitchhiker  0.00000289495 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2265  helix-turn-helix domain-containing protein  39.66 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43580  DNA binding protein, XRE-like protein  38.71 
 
 		 85 aa  40.4  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.485824  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3410  transcriptional regulator, XRE family protein  66.67 
 
 		 64 aa  40.4  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>