64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4570 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4570  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 99 aa  200  7e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.27714 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04053  Transcriptional Regulator, XRE family protein  38.46 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0549  transcriptional regulator, XRE family  35.05 
 
 		 103 aa  60.1  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3182  transcriptional regulator, XRE family  46.05 
 
 		 513 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0470208  hitchhiker  0.000000000985397 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15700  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  44.93 
 
 		 507 aa  53.9  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.645755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3350  XRE family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3478  XRE family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 115 aa  52  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3247  XRE family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1125  XRE family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17690  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  49.18 
 
 		 517 aa  51.2  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.356525  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1896  transcriptional regulator, XRE family  50.94 
 
 		 512 aa  50.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2672  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  54.24 
 
 		 508 aa  50.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1872  XRE family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.765913  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4217  helix-turn-helix domain-containing protein  38.24 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.538571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13300  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  50.91 
 
 		 509 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.801467  normal  0.209244 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3380  XRE family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.738813  hitchhiker  0.00256975 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4552  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3260  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 513 aa  47  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0795644  normal  0.23679 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0041  XRE family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0512908  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0404  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 126 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1652  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000422118  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1357  helix-turn-helix domain-containing protein  37.1 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.222468  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3103  transcriptional regulator, XRE family  43.1 
 
 		 503 aa  43.9  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597911  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1476  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  30.11 
 
 		 264 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6040  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.591688 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  43.64 
 
 		 181 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5660  XRE family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 490 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176576  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7198  transcriptional regulator, XRE family  43.64 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0637638 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3542  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1547  XRE family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.358445  normal  0.0388732 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0267  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257195  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 181 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2442  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 86 aa  42  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1622  transcriptional regulator, XRE family  35.16 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  43.64 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  43.64 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0972  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 		 228 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.385835 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  44.26 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 181 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  43.64 
 
 		 181 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2898  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  43.64 
 
 		 181 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2252  XRE family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00411497  normal  0.680338 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  44.26 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1361  EPSP synthase (3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase)  43.64 
 
 		 516 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419571  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0858  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 497 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.359757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2892  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.203012 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20520  DNA binding protein, XRE family  34.72 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 220 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0364  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000740846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1297  transcriptional regulator, XRE family  31.82 
 
 		 182 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.814605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6264  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 188 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0000184029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2262  helix-turn-helix domain-containing protein  29.33 
 
 		 293 aa  40.8  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.827528  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1909  XRE family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6814  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 102 aa  40.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5565  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 81 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5293  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 81 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3867  Cro/CI family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 75 aa  40.8  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1274  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 212 aa  40.4  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0650  XRE family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 91 aa  40  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0669  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 383 aa  40  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0688  XRE family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 110 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>