232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_0364 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007644  Moth_0364  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 100 aa  203  8e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000740846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0084  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3411  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 97 aa  68.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1138  transcriptional regulator, XRE family  39.33 
 
 		 90 aa  67.4  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.4972  normal  0.249316 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1031  transcriptional regulator, XRE family  42.17 
 
 		 89 aa  66.6  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000313321  normal  0.707924 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1165  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre family  36.14 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000604987 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1361  transcriptional regulator, XRE family  43.59 
 
 		 93 aa  64.7  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0763  XRE family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2529  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 93 aa  64.7  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000784971  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0593  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0244812  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2319  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2419  transcriptional regulator, XRE family  36.17 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1462  XRE family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 104 aa  62  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0928  DNA polymerase III delta prime subunit  33.33 
 
 		 90 aa  61.6  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1829  transcriptional regulator, XRE family  35.16 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1336  XRE family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40166 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2564  XRE family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2735  XRE family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0601  transcriptional regulator, XRE family  38.04 
 
 		 108 aa  60.1  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4384  transcriptional regulator, XRE family  35.92 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1542  hypothetical protein  36.92 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4023  transcriptional regulator, XRE family  38.16 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0074  hypothetical protein  36.84 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5447  XRE family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0870  transcriptional regulator, XRE family  34.12 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1888  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3859  transcriptional regulator, XRE family  36.71 
 
 		 93 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7086  transcriptional regulator, XRE family  35.11 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.633613  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0834  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.259279 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3174  XRE family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00826056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1724  transcriptional regulator, XRE family  33.72 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2243  transcriptional regulator, XRE family  31.71 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2042  putative cytochrome c  35.94 
 
 		 90 aa  53.5  0.0000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0117  putative DNA-binding protein  34.09 
 
 		 105 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197061  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0930  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00205943  normal  0.115025 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0889  putative transcriptional regulator, XRE family  31.71 
 
 		 99 aa  52  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2787  transcriptional regulator, XRE family  43.1 
 
 		 99 aa  51.6  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0827  XRE family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 116 aa  51.2  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.551431  normal  0.496549 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0315  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0773865 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0723  transcriptional regulator, XRE family  31.71 
 
 		 115 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000669172 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1144  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 266 aa  50.4  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 176 aa  50.4  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3276  hypothetical protein  31.71 
 
 		 105 aa  50.8  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  44.83 
 
 		 188 aa  50.4  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0455  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 214 aa  50.4  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000298649 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1124  XRE family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.969354  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01487  phage N15 gp48-like protein  30.23 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.497667  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01498  hypothetical protein  30.23 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0282  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3620  transcriptional regulator, XRE family  30.49 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494695  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4003  transcriptional regulator, XRE family  49.02 
 
 		 61 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0461  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1481  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1496  XRE family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1451  helix-turn-helix domain-containing protein  33.71 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1349  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 97 aa  47.8  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8282  putative transcriptional regulator, XRE family  36.05 
 
 		 92 aa  47.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145655  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  36.84 
 
 		 255 aa  47.8  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3540  transcriptional regulator, XRE family  32.18 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  46.81 
 
 		 256 aa  47.4  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0631  hypothetical protein  44.64 
 
 		 73 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3505  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 		 97 aa  47  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0311  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0807  helix-turn-helix domain-containing protein  27.96 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0009  HTH-type transcriptional regulator SinR  44.9 
 
 		 60 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0891  XRE family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 106 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1879  DNA-binding protein  28.57 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5087  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 78 aa  45.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000142264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4931  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 187 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1231  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 69 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0450833  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0658  XRE family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 95 aa  46.2  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 		 189 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1256  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 491 aa  45.1  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1414  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 179 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0298473 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5637  transcriptional regulator, XRE family  31.17 
 
 		 227 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.76756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6574  transcriptional regulator, XRE family  31.17 
 
 		 227 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0448941 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  35.82 
 
 		 175 aa  45.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6009  XRE family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 219 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.285081  hitchhiker  0.00726065 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3086  transcriptional regulator, putative  37.5 
 
 		 212 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0196484  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2733  helix-turn-helix domain-containing protein  39.66 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000416248  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1655  helix-turn-helix domain protein  39.29 
 
 		 194 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000652652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0455  helix-turn-helix domain-containing protein  43.64 
 
 		 84 aa  45.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.846585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2346  transcriptional regulator  29.76 
 
 		 215 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2483  transcriptional regulator, XRE family  32.05 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4415  XRE family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 213 aa  43.9  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4162  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0885  XRE family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 218 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0538  XRE family transcriptional regulator  52.5 
 
 		 202 aa  43.9  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11984  transcriptional regulator  33.75 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 198 aa  43.9  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1885  transcriptional regulator, XRE family  44.64 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000259455 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3256  helix-turn-helix domain-containing protein  28.92 
 
 		 136 aa  43.5  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0874  putative transcriptional regulator, XRE family  24.1 
 
 		 117 aa  43.5  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  46 
 
 		 68 aa  43.5  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  39.58 
 
 		 210 aa  43.5  0.0009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0544  XRE family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 203 aa  43.5  0.0009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0116  XRE family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 205 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0574196 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 300 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>